More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0883 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
376 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  93.62 
 
 
378 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.97 
 
 
374 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.97 
 
 
374 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.43 
 
 
374 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.4 
 
 
378 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.07 
 
 
383 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.6 
 
 
377 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  55.53 
 
 
383 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  50.53 
 
 
370 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.74 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.49 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  51.64 
 
 
375 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  50.55 
 
 
378 aa  305  7e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  45.09 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.15 
 
 
376 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.15 
 
 
376 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.15 
 
 
376 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.89 
 
 
376 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.03 
 
 
377 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.69 
 
 
373 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.69 
 
 
373 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.09 
 
 
375 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.61 
 
 
373 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.42 
 
 
373 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.95 
 
 
378 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.67 
 
 
367 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.58 
 
 
371 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.42 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.58 
 
 
373 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.73 
 
 
373 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.21 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.42 
 
 
372 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.93 
 
 
380 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.9 
 
 
377 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.9 
 
 
360 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.8 
 
 
317 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.49 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  29.89 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.61 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.99 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.6 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  29.75 
 
 
363 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.97 
 
 
315 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.8 
 
 
331 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.65 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.93 
 
 
314 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.93 
 
 
314 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  28.65 
 
 
364 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.69 
 
 
364 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.06 
 
 
315 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.33 
 
 
326 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.04 
 
 
378 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  29.75 
 
 
363 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.62 
 
 
355 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.62 
 
 
355 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.42 
 
 
364 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  28.42 
 
 
365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  27.5 
 
 
364 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25 
 
 
316 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  28.1 
 
 
364 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  28.1 
 
 
364 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  28 
 
 
355 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  23.95 
 
 
316 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  23.96 
 
 
326 aa  99.8  7e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.45 
 
 
316 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.02 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.02 
 
 
338 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.55 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  24.59 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.88 
 
 
309 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  26.61 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.55 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.73 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.58 
 
 
313 aa  93.2  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.52 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.49 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.87 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.3 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.55 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.77 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.15 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  26.53 
 
 
314 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  29.1 
 
 
324 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.88 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.52 
 
 
311 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.71 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.77 
 
 
320 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05854  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00375151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.16 
 
 
321 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  40.88 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.69 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.71 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.52 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28.81 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.68 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.29 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.91 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.28 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>