More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0706 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  99.47 
 
 
374 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
374 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
374 aa  756    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.97 
 
 
376 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  79.09 
 
 
378 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.59 
 
 
383 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  58.47 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.84 
 
 
378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.29 
 
 
377 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  51.99 
 
 
370 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.52 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.21 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  50.93 
 
 
375 aa  320  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  46.84 
 
 
376 aa  318  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.98 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.76 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.76 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.76 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  50.69 
 
 
378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.23 
 
 
376 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.32 
 
 
367 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.67 
 
 
378 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.15 
 
 
367 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.26 
 
 
373 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.11 
 
 
375 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.74 
 
 
373 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.43 
 
 
373 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.95 
 
 
373 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.95 
 
 
373 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.68 
 
 
373 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.24 
 
 
373 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.37 
 
 
371 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.58 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.36 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.78 
 
 
377 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.27 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  28 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.56 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  31.75 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.18 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.79 
 
 
338 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.41 
 
 
313 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.83 
 
 
363 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.07 
 
 
315 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.53 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  29.95 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  29.48 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.26 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.26 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.57 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  28.06 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.38 
 
 
326 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.84 
 
 
315 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  28.89 
 
 
363 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  29.2 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.73 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.94 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.73 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.2 
 
 
364 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  29.2 
 
 
365 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.63 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  28.93 
 
 
364 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  28.93 
 
 
364 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.74 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.46 
 
 
316 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  23.82 
 
 
316 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  29.11 
 
 
409 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  27.25 
 
 
355 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.59 
 
 
317 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.98 
 
 
363 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.68 
 
 
359 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.98 
 
 
311 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  29.57 
 
 
323 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.53 
 
 
360 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  24.59 
 
 
321 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.06 
 
 
341 aa  99.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.12 
 
 
334 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.65 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.73 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.34 
 
 
350 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  23.81 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.65 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.56 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.61 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.87 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.91 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.63 
 
 
311 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.94 
 
 
324 aa  94  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.84 
 
 
353 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.88 
 
 
324 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.34 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.5 
 
 
319 aa  93.2  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  26.54 
 
 
359 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.41 
 
 
342 aa  93.2  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.24 
 
 
319 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.5 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.84 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.7 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.22 
 
 
326 aa  92  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  26.33 
 
 
321 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>