More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0346 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  100 
 
 
319 aa  636    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  83.39 
 
 
321 aa  522  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  60.9 
 
 
316 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.75 
 
 
313 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  63.43 
 
 
320 aa  347  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.66 
 
 
315 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.55 
 
 
316 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  54.22 
 
 
317 aa  333  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  55.12 
 
 
326 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  54.84 
 
 
316 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  55.23 
 
 
321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  54.43 
 
 
315 aa  325  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  55.92 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.13 
 
 
323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  52.16 
 
 
323 aa  302  6.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.72 
 
 
325 aa  301  8.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  52.24 
 
 
314 aa  298  9e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  51.78 
 
 
314 aa  286  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.78 
 
 
314 aa  286  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.14 
 
 
309 aa  277  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.51 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  45.54 
 
 
314 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  44.19 
 
 
313 aa  226  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.35 
 
 
313 aa  220  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  41.42 
 
 
311 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.51 
 
 
311 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.52 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.3 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.98 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.92 
 
 
338 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.92 
 
 
334 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.09 
 
 
328 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.35 
 
 
342 aa  209  6e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.95 
 
 
316 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.2 
 
 
323 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.34 
 
 
328 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.29 
 
 
335 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.06 
 
 
323 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.61 
 
 
331 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.24 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.34 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
324 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.39 
 
 
354 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.92 
 
 
324 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  34.15 
 
 
348 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.03 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.92 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.42 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  36.86 
 
 
281 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.46 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.41 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.34 
 
 
345 aa  195  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.49 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.22 
 
 
326 aa  195  9e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.41 
 
 
342 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  38.15 
 
 
334 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.36 
 
 
319 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.11 
 
 
328 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.39 
 
 
323 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.12 
 
 
319 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.01 
 
 
315 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.74 
 
 
312 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.42 
 
 
325 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.84 
 
 
352 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.06 
 
 
324 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.33 
 
 
331 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.44 
 
 
329 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.65 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.98 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.33 
 
 
332 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.42 
 
 
311 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.02 
 
 
325 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.95 
 
 
355 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  35.02 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.13 
 
 
331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.38 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.38 
 
 
330 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.81 
 
 
325 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.16 
 
 
328 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.81 
 
 
332 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.81 
 
 
332 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.81 
 
 
332 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  35.31 
 
 
355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 
356 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 
356 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 
356 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.45 
 
 
362 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.08 
 
 
355 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.03 
 
 
380 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.08 
 
 
355 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.74 
 
 
386 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.21 
 
 
305 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.38 
 
 
327 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.57 
 
 
356 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
354 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.29 
 
 
327 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.12 
 
 
305 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.62 
 
 
334 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.71 
 
 
369 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>