More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2031 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 342 aa  683    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  76.16 
 
 		 325 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  71.12 
 
 		 331 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.68 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70.5 
 
 		 331 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.7 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  71.38 
 
 		 334 aa  447  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.12 
 
 		 325 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  67.82 
 
 		 324 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.69 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  66.98 
 
 		 328 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.04 
 
 		 328 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.35 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.85 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.35 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.35 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.34 
 
 		 326 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.24 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.62 
 
 		 325 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.12 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.88 
 
 		 329 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.89 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.41 
 
 		 323 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.94 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.63 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.38 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.49 
 
 		 323 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.68 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.99 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.68 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.68 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.88 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.82 
 
 		 327 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.37 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.85 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.51 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.49 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.74 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.38 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.89 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  56.97 
 
 		 334 aa  345  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  51.88 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  47.26 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  51.19 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.44 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.63 
 
 		 319 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.86 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  40.57 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.78 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.87 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.34 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  36.6 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.81 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.16 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.2 
 
 		 315 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.54 
 
 		 313 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.49 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.98 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  35.35 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.67 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.17 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.91 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.59 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  35.69 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  35.29 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  35.96 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.62 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.25 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.76 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.49 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.76 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.99 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.63 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.42 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.81 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.38 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.7 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2734  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.52 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.3 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.11 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.69 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.51 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  34.19 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  33.72 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.25 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.57 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.94 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.44 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.93 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.02 
 
 		 378 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.85 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.61 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.4 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.94 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  33.33 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.74 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.53 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.06 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>