More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3073 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 327 aa  666    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  87.12 
 
 		 326 aa  590  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  87.04 
 
 		 326 aa  588  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  75.77 
 
 		 339 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.63 
 
 		 334 aa  447  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.77 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.43 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.8 
 
 		 332 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.58 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.12 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.95 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.56 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.73 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.7 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.82 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.92 
 
 		 323 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.46 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.51 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  60.19 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.54 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.54 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.54 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.42 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.36 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.56 
 
 		 324 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.78 
 
 		 323 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.51 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.59 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.7 
 
 		 324 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.92 
 
 		 324 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.31 
 
 		 328 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  56 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.31 
 
 		 328 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.31 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.77 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  55.96 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.05 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.69 
 
 		 325 aa  351  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  55.08 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.08 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.11 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  46.4 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  48.29 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  51.78 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.68 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.03 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  41.88 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.07 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.39 
 
 		 315 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  36.57 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.59 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.94 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.06 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.74 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.92 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.65 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.02 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.87 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.92 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.29 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.06 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  34.71 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.26 
 
 		 314 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.26 
 
 		 314 aa  158  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  34.46 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.22 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.69 
 
 		 353 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  32.28 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  32.41 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.61 
 
 		 353 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.13 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.64 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.22 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.91 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.06 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  33.54 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.08 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.29 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.92 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  32.2 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.29 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.86 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.49 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.49 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.49 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.59 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.95 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.83 
 
 		 320 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.2 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.48 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.73 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.17 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.79 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.51 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2746  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.96 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.881958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  30.81 
 
 		 363 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>