More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4686 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 356 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 356 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 356 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  91.57 
 
 		 356 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  90.17 
 
 		 356 aa  617  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  84.46 
 
 		 355 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3984  2-nitropropane dioxygenase NPD  73.55 
 
 		 361 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.23 
 
 		 351 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2746  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.1 
 
 		 362 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.881958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.69 
 
 		 369 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.29 
 
 		 386 aa  404  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.29 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.42 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1378  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.74 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.89 
 
 		 358 aa  319  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.19 
 
 		 362 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.47 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2157  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.11 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1561  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.69 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.31 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.71 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.38 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.47 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.29 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.53 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.53 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  35.28 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.94 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.94 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  32.94 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  34 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.52 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.31 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.71 
 
 		 331 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.48 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.15 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.62 
 
 		 315 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.75 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.67 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.34 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.92 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.14 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.48 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.48 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.29 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.39 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.28 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.89 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.18 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.02 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  32.44 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  39.52 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.84 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.75 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.73 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.39 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.77 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.74 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.77 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.66 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.68 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.52 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  38.06 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.14 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.58 
 
 		 319 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.08 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.46 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.46 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.66 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.6 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.46 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.66 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.44 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.9 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.86 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.9 
 
 		 324 aa  143  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.23 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.39 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.82 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.37 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.67 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.1 
 
 		 363 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  32.98 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.11 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  32.77 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  33.71 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.86 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.57 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.5 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.48 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.12 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  30 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.77 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.9 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>