More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4621 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
358 aa  710    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.21 
 
 
369 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.2 
 
 
386 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.45 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.27 
 
 
353 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.33 
 
 
353 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.01 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.73 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.31 
 
 
356 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.31 
 
 
356 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.31 
 
 
356 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  53.6 
 
 
355 aa  332  8e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1378  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.26 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36272  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3984  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.13 
 
 
361 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2746  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.86 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.881958  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.05 
 
 
354 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.2 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2157  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.78 
 
 
384 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.09 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1561  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.86 
 
 
360 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.53 
 
 
315 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.46 
 
 
326 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.75 
 
 
323 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.5 
 
 
316 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.29 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.88 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  35.38 
 
 
317 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.96 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.96 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.81 
 
 
324 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.56 
 
 
331 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.43 
 
 
309 aa  176  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  37.22 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.53 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.38 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.56 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.72 
 
 
331 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.57 
 
 
355 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.28 
 
 
324 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.61 
 
 
313 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  35 
 
 
332 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.57 
 
 
319 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.8 
 
 
328 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.49 
 
 
331 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.37 
 
 
329 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
332 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
332 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
332 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  32.94 
 
 
361 aa  166  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.47 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.47 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.75 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.1 
 
 
325 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  35 
 
 
325 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.36 
 
 
325 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.11 
 
 
332 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  33.62 
 
 
321 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  34.33 
 
 
321 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.9 
 
 
317 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.38 
 
 
315 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.15 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.39 
 
 
330 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.96 
 
 
328 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.69 
 
 
316 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.83 
 
 
342 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.81 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.43 
 
 
313 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.61 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.03 
 
 
338 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  41.08 
 
 
319 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.8 
 
 
314 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.19 
 
 
380 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 
325 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  30.53 
 
 
363 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  35.89 
 
 
364 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.99 
 
 
326 aa  149  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.38 
 
 
323 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.03 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.03 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  36.27 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.66 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.78 
 
 
320 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.24 
 
 
316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  32.55 
 
 
314 aa  146  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.47 
 
 
328 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  35.54 
 
 
364 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.9 
 
 
311 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.84 
 
 
378 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  35.54 
 
 
364 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.08 
 
 
327 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  35.54 
 
 
364 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  35.54 
 
 
365 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  34.92 
 
 
328 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.77 
 
 
345 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.41 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.22 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  35.19 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  35.19 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.89 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.1 
 
 
355 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>