More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  100 
 
 
324 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  71.34 
 
 
332 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  71.34 
 
 
332 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  71.34 
 
 
332 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  73.15 
 
 
325 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70.72 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.7 
 
 
331 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.01 
 
 
331 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.01 
 
 
332 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.63 
 
 
325 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.12 
 
 
332 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.47 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.82 
 
 
342 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.47 
 
 
329 aa  431  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.76 
 
 
325 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.31 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.34 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.2 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.23 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.38 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  64.4 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.81 
 
 
324 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.5 
 
 
324 aa  394  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.57 
 
 
335 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.19 
 
 
328 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.97 
 
 
323 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.19 
 
 
324 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.03 
 
 
324 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.89 
 
 
324 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  63.64 
 
 
323 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.63 
 
 
328 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.19 
 
 
327 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.75 
 
 
326 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.06 
 
 
326 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.69 
 
 
324 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.1 
 
 
328 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.33 
 
 
327 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.74 
 
 
323 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  57.94 
 
 
334 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.19 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.43 
 
 
328 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  53.42 
 
 
340 aa  293  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  47.55 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  54.07 
 
 
269 aa  256  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.19 
 
 
322 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.61 
 
 
319 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.26 
 
 
319 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.81 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  37.46 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.61 
 
 
313 aa  212  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  39.87 
 
 
278 aa  206  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.46 
 
 
316 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.51 
 
 
316 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.79 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.56 
 
 
319 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.51 
 
 
311 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.9 
 
 
314 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.22 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.51 
 
 
313 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.6 
 
 
317 aa  185  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.58 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.08 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  35.08 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  34.75 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.02 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  33.96 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  35.48 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.54 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.06 
 
 
319 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.54 
 
 
313 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.64 
 
 
312 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.87 
 
 
316 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.48 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.54 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.65 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.27 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.97 
 
 
311 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.29 
 
 
314 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.75 
 
 
318 aa  160  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2734  putative 2-nitropropane dioxygenase  37.46 
 
 
319 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36 
 
 
305 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.66 
 
 
314 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.66 
 
 
314 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  30.82 
 
 
323 aa  153  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
338 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.69 
 
 
305 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.06 
 
 
355 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.13 
 
 
326 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.91 
 
 
326 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1729  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.22 
 
 
326 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.9 
 
 
354 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.43 
 
 
351 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  32.76 
 
 
355 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.91 
 
 
331 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.66 
 
 
315 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.93 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.23 
 
 
353 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  32.94 
 
 
361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.91 
 
 
369 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>