More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3984 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3984  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 361 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  73.26 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  73.55 
 
 		 356 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  73.41 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  72.08 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  73.55 
 
 		 356 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  73.55 
 
 		 356 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.43 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2746  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.12 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.881958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.08 
 
 		 369 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.77 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.21 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.69 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1378  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.81 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.13 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.01 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.33 
 
 		 362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2157  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.32 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.77 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1561  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.1 
 
 		 360 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.39 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.86 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.52 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.53 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.34 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  36.26 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.43 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.17 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.93 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.9 
 
 		 314 aa  176  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.9 
 
 		 314 aa  176  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.67 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.92 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.19 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  31.99 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.63 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.56 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.09 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.17 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.52 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.47 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.25 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  33.43 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.23 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.02 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.14 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.21 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.71 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.09 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.15 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.2 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.48 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.62 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.98 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.76 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.5 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.38 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.62 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.02 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  34.94 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.71 
 
 		 328 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.83 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.62 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.44 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.57 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.57 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.57 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.9 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.9 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.01 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  30.79 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.62 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.29 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.66 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.58 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.94 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.72 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.91 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  32.81 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.59 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  30.95 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.13 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.83 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  34.12 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  32.7 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.58 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.22 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.9 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.07 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  32.49 
 
 		 318 aa  137  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.11 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  29.57 
 
 		 348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.89 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>