More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11150 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  100 
 
 
323 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  77.57 
 
 
325 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  53.16 
 
 
316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.96 
 
 
316 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.97 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.98 
 
 
315 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.21 
 
 
316 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  54.18 
 
 
326 aa  306  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  53.31 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  51.5 
 
 
317 aa  305  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  52.19 
 
 
321 aa  299  5e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  51.8 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  53.33 
 
 
314 aa  285  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  50.99 
 
 
320 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.67 
 
 
323 aa  278  7e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.68 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  52.68 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  50.32 
 
 
318 aa  265  8e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.42 
 
 
309 aa  259  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  46.23 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.15 
 
 
313 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.14 
 
 
317 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.76 
 
 
313 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  41.31 
 
 
311 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.16 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  38.21 
 
 
314 aa  195  7e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.05 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.39 
 
 
319 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.83 
 
 
319 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.67 
 
 
319 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.74 
 
 
323 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.31 
 
 
329 aa  185  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.5 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  37.04 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.71 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.2 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.73 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.99 
 
 
327 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.82 
 
 
314 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.97 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.68 
 
 
313 aa  179  7e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  36 
 
 
328 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.91 
 
 
325 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1961  dioxygenase  34.93 
 
 
281 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
331 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.58 
 
 
338 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.69 
 
 
331 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.24 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.46 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.47 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.25 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.75 
 
 
332 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.77 
 
 
328 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.57 
 
 
335 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.54 
 
 
323 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.96 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.26 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.02 
 
 
331 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.21 
 
 
311 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.14 
 
 
342 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.95 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.39 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.38 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.62 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.62 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.62 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.67 
 
 
352 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.5 
 
 
342 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.4 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.17 
 
 
354 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.81 
 
 
345 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.4 
 
 
338 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.67 
 
 
334 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.68 
 
 
327 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.48 
 
 
323 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.82 
 
 
342 aa  156  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.13 
 
 
323 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.84 
 
 
325 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  30.77 
 
 
324 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.63 
 
 
330 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.78 
 
 
339 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.48 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.3 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.63 
 
 
386 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.76 
 
 
355 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.76 
 
 
355 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.18 
 
 
331 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.99 
 
 
326 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.38 
 
 
378 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.69 
 
 
326 aa  150  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.72 
 
 
345 aa  150  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  32.71 
 
 
328 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  29.38 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.74 
 
 
305 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.02 
 
 
305 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.4 
 
 
328 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.31 
 
 
315 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.19 
 
 
362 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.95 
 
 
353 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.86 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>