More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1839 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 319 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  88.09 
 
 		 319 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.86 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  47.95 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.59 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.95 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.22 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.48 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.77 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.27 
 
 		 324 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.82 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.71 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.45 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.94 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.2 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.83 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.25 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  43.49 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.72 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.37 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.83 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  44.26 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.44 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.24 
 
 		 324 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.9 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.9 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.9 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.93 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.86 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  44.97 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.19 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.94 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  44.48 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.81 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.9 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.82 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.81 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.96 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.45 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.07 
 
 		 327 aa  231  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.53 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.87 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.49 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.46 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  41.61 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.31 
 
 		 325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.94 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.17 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.08 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.23 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.45 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  43.45 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.31 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.19 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.9 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  42.68 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  41.29 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  38.69 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  38.92 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.27 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.81 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  39.57 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.19 
 
 		 324 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.42 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.72 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.08 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  42.86 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  40.32 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.58 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.56 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  37.42 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.16 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  37.14 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.9 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.58 
 
 		 338 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.6 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  37.7 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.58 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  35.48 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  34.9 
 
 		 361 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  32.77 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.69 
 
 		 363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.17 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 		 363 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.02 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  38.02 
 
 		 346 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  37.89 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.44 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.9 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.94 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.17 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.79 
 
 		 355 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.79 
 
 		 355 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  30.77 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.2 
 
 		 326 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.2 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.75 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.2 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.26 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  31.02 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>