More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4414 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
321 aa  631  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.25 
 
 
331 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.82 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  42.95 
 
 
317 aa  215  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.82 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.11 
 
 
360 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.83 
 
 
338 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.79 
 
 
380 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.96 
 
 
326 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.9 
 
 
316 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.5 
 
 
323 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  41.03 
 
 
346 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.97 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.01 
 
 
314 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.65 
 
 
324 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.06 
 
 
325 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.01 
 
 
314 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.91 
 
 
323 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.66 
 
 
316 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.65 
 
 
324 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.69 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.45 
 
 
319 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  37.03 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.31 
 
 
328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.18 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.95 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.05 
 
 
324 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.12 
 
 
342 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.04 
 
 
324 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.48 
 
 
326 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.52 
 
 
386 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.22 
 
 
309 aa  176  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.43 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.47 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.88 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.65 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.65 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  40.95 
 
 
355 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.65 
 
 
319 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.75 
 
 
354 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.04 
 
 
314 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  39.33 
 
 
409 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  34.62 
 
 
363 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  34.62 
 
 
363 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  34.39 
 
 
370 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.63 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.67 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  35.58 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.24 
 
 
313 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.13 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  39.69 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.44 
 
 
380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.72 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.15 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.14 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  35.14 
 
 
321 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.31 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.76 
 
 
325 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.18 
 
 
377 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.87 
 
 
319 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  33.89 
 
 
364 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.82 
 
 
356 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38 
 
 
356 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.04 
 
 
378 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.09 
 
 
323 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.22 
 
 
311 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 
364 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  34.09 
 
 
314 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.92 
 
 
332 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.92 
 
 
332 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.92 
 
 
332 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  33.52 
 
 
364 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.79 
 
 
345 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.29 
 
 
334 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.25 
 
 
331 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.35 
 
 
325 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  32.7 
 
 
365 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  45.16 
 
 
355 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.9 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.04 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.9 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.9 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.76 
 
 
327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  33.24 
 
 
364 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.14 
 
 
351 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.58 
 
 
330 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.11 
 
 
362 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.69 
 
 
323 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.06 
 
 
331 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.42 
 
 
350 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  33.05 
 
 
364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  33.05 
 
 
364 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.15 
 
 
323 aa  153  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.63 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.65 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.53 
 
 
329 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.12 
 
 
383 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 
378 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  35.03 
 
 
311 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.04 
 
 
353 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>