More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02830 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  100 
 
 
409 aa  836    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  58.19 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  56.14 
 
 
346 aa  338  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05854  conserved hypothetical protein  52.46 
 
 
353 aa  300  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00375151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.79 
 
 
331 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.63 
 
 
380 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00102  hypothetical protein  42.24 
 
 
326 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.21 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.88 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.67 
 
 
338 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.44 
 
 
321 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.02 
 
 
311 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.02 
 
 
323 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.43 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  35.88 
 
 
314 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  33.53 
 
 
321 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.06 
 
 
313 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.4 
 
 
314 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.4 
 
 
314 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.22 
 
 
380 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  31.74 
 
 
317 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.23 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  27.44 
 
 
370 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.39 
 
 
369 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.82 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.95 
 
 
316 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.11 
 
 
374 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.11 
 
 
374 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.71 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.62 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.84 
 
 
374 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.04 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.87 
 
 
356 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.87 
 
 
356 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.87 
 
 
356 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.68 
 
 
328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  32.95 
 
 
333 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.53 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.87 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.25 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.57 
 
 
328 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.77 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.09 
 
 
324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.97 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 
356 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.52 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.51 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.66 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.61 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.66 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.99 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
314 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.76 
 
 
324 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.17 
 
 
326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.65 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.04 
 
 
367 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.3 
 
 
373 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  36.47 
 
 
355 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.16 
 
 
319 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.69 
 
 
378 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.25 
 
 
324 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.75 
 
 
325 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.35 
 
 
373 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.6 
 
 
376 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.04 
 
 
369 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.56 
 
 
331 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.79 
 
 
367 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  30.81 
 
 
321 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.17 
 
 
309 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.65 
 
 
331 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.46 
 
 
332 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.91 
 
 
363 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.84 
 
 
319 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  32.64 
 
 
318 aa  122  9e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.17 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.05 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.17 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.07 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.17 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.81 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  33.22 
 
 
351 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.7 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  28 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  33.22 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.96 
 
 
315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.23 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.68 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.81 
 
 
329 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.85 
 
 
319 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.21 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  28.94 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.04 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.34 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  33.43 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.75 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.49 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.71 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
324 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>