More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2835 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 373 aa  730    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  87.05 
 
 		 373 aa  600  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.68 
 
 		 367 aa  492  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.21 
 
 		 367 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.53 
 
 		 378 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.94 
 
 		 373 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.94 
 
 		 373 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.22 
 
 		 373 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.12 
 
 		 373 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.68 
 
 		 373 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.74 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.72 
 
 		 376 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  53.49 
 
 		 370 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  51.6 
 
 		 383 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.09 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  50.13 
 
 		 375 aa  299  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.62 
 
 		 377 aa  298  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  45.45 
 
 		 376 aa  298  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.01 
 
 		 376 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.01 
 
 		 376 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.01 
 
 		 376 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  49.06 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.43 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.43 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.99 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.43 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.89 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.61 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.28 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.33 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.01 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.08 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.13 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.14 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.62 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.79 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.04 
 
 		 380 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.53 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.08 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.08 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.85 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  26.4 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  26.4 
 
 		 364 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  35.25 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.73 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  28.61 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  26.4 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  26.13 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.2 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.08 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  27.49 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  26.13 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  26.13 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.74 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  26.61 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.9 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.7 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  28.34 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.46 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.27 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.54 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.15 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.13 
 
 		 338 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.58 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.27 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.78 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.65 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.75 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.61 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.62 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.02 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.02 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  27.95 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25.75 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.66 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  27.45 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.6 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.92 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.85 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.55 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.93 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  35.2 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.16 
 
 		 341 aa  103  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.26 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.87 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  30.36 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  27.21 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.74 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.61 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.07 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  33.12 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.67 
 
 		 319 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.67 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.24 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  31.09 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.06 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.69 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.58 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>