More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1544 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  90.05 
 
 		 373 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 373 aa  752    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  90.05 
 
 		 373 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  94.91 
 
 		 373 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  89.78 
 
 		 373 aa  663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.99 
 
 		 378 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  69 
 
 		 367 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.12 
 
 		 367 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.22 
 
 		 373 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.78 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.86 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  51.73 
 
 		 370 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.34 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  46.21 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.75 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.61 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.6 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.6 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.6 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  47.07 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.74 
 
 		 374 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.74 
 
 		 374 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.15 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.47 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.88 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.42 
 
 		 376 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.32 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  44.65 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.01 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.83 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  44.47 
 
 		 378 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.36 
 
 		 371 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.45 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.62 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.48 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.52 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.63 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  31.07 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.79 
 
 		 364 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  30.79 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  30.79 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.94 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  28.5 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.79 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.64 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.57 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.87 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  31.36 
 
 		 363 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.86 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.86 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.59 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.94 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.61 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.91 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  35.97 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.2 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  28.53 
 
 		 321 aa  120  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.22 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.55 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.65 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.26 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.72 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.93 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.73 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.38 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.38 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.17 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  34.03 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.64 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  29.79 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.94 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  28.95 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.93 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.53 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.52 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.76 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.37 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.64 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.27 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.26 
 
 		 309 aa  99.4  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.78 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  29.46 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.81 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.92 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.11 
 
 		 319 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.02 
 
 		 314 aa  96.3  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.89 
 
 		 311 aa  96.3  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.62 
 
 		 321 aa  96.3  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.89 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.71 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.53 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.86 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.3 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  27.96 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.89 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.3 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.37 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.39 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>