More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4626 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  87.37 
 
 
373 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  98.12 
 
 
373 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
373 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  90.05 
 
 
373 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
373 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.1 
 
 
378 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.19 
 
 
367 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.01 
 
 
367 aa  498  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.94 
 
 
373 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.27 
 
 
373 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.4 
 
 
369 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.56 
 
 
376 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  51.59 
 
 
370 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  45.95 
 
 
376 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.88 
 
 
376 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.92 
 
 
383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  47.24 
 
 
383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.11 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.11 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.11 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.97 
 
 
377 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.95 
 
 
374 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.95 
 
 
374 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.68 
 
 
374 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.95 
 
 
378 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  45.69 
 
 
375 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.69 
 
 
376 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.81 
 
 
375 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.01 
 
 
372 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.27 
 
 
371 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.34 
 
 
377 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  44.3 
 
 
378 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.74 
 
 
378 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.67 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.16 
 
 
377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.97 
 
 
360 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  36 
 
 
380 aa  169  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.66 
 
 
364 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  30.23 
 
 
364 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  29.94 
 
 
365 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  28.5 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.69 
 
 
315 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  29.66 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  29.66 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  29.53 
 
 
363 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  29.66 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.9 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  31.36 
 
 
363 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.18 
 
 
315 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.66 
 
 
363 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.89 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  32.9 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.33 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.6 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.6 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.59 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  27.27 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.69 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  28.53 
 
 
321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.11 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.65 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.99 
 
 
316 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.79 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.79 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.03 
 
 
316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.02 
 
 
350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.32 
 
 
326 aa  112  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  30.34 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.54 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.72 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.65 
 
 
309 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.54 
 
 
356 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.75 
 
 
318 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.08 
 
 
314 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.01 
 
 
353 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  27.66 
 
 
409 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.68 
 
 
345 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.53 
 
 
319 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.93 
 
 
360 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.79 
 
 
362 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  30.08 
 
 
368 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  29.71 
 
 
355 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.81 
 
 
319 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.35 
 
 
335 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.42 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.93 
 
 
320 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.71 
 
 
311 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.81 
 
 
354 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.26 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.52 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.68 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.97 
 
 
326 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.84 
 
 
352 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.42 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  29.33 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.63 
 
 
338 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.4 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  26.49 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.87 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  29.75 
 
 
314 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>