More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5008 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  87.37 
 
 
373 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
373 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  98.12 
 
 
373 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  89.78 
 
 
373 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  98.12 
 
 
373 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.36 
 
 
378 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.28 
 
 
367 aa  498  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.65 
 
 
367 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.12 
 
 
373 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.56 
 
 
376 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.87 
 
 
369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  51.85 
 
 
370 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  45.17 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.09 
 
 
376 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.92 
 
 
383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  46.98 
 
 
383 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.34 
 
 
376 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.34 
 
 
376 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.34 
 
 
376 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.71 
 
 
377 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.68 
 
 
374 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.68 
 
 
374 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.42 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  45.69 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.69 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.42 
 
 
376 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.55 
 
 
375 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.27 
 
 
372 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.6 
 
 
377 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.27 
 
 
371 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  44.04 
 
 
378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.74 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.1 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.16 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.14 
 
 
360 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.84 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.22 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.1 
 
 
364 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  29.66 
 
 
364 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  29.38 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  29.27 
 
 
363 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  29.38 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  29.1 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  29.1 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  29.1 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.34 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.42 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.45 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  30.79 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.12 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.46 
 
 
363 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.92 
 
 
313 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  35.55 
 
 
346 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.13 
 
 
355 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.13 
 
 
355 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.31 
 
 
317 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.34 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.99 
 
 
321 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  28.25 
 
 
321 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.63 
 
 
323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.89 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.44 
 
 
316 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.75 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.58 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  30.34 
 
 
355 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.79 
 
 
326 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.99 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.99 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.15 
 
 
341 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.32 
 
 
311 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.48 
 
 
314 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.75 
 
 
318 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.84 
 
 
309 aa  106  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.28 
 
 
356 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.32 
 
 
360 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.05 
 
 
362 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  27.3 
 
 
409 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.79 
 
 
353 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.68 
 
 
345 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  30.13 
 
 
355 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  29.82 
 
 
368 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.66 
 
 
319 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  30.13 
 
 
350 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.84 
 
 
334 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.35 
 
 
335 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.55 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.75 
 
 
363 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.7 
 
 
352 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.76 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.54 
 
 
319 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.65 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.71 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.55 
 
 
354 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.8 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.17 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  29 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.33 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.02 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.44 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>