More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3005 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  90.98 
 
 
377 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  88.3 
 
 
376 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  92.29 
 
 
376 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  92.29 
 
 
376 aa  701    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  92.29 
 
 
376 aa  701    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
376 aa  773    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  84.86 
 
 
375 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  52.82 
 
 
370 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.6 
 
 
369 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.87 
 
 
376 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.23 
 
 
374 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.56 
 
 
383 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.23 
 
 
374 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.23 
 
 
374 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.34 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.76 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.88 
 
 
373 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.88 
 
 
373 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.09 
 
 
373 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.21 
 
 
378 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.89 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.61 
 
 
373 aa  299  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  47.48 
 
 
375 aa  298  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.01 
 
 
373 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.79 
 
 
378 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  45.03 
 
 
383 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.37 
 
 
373 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.99 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.44 
 
 
377 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.38 
 
 
372 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.31 
 
 
378 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.64 
 
 
371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  41.1 
 
 
378 aa  248  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.02 
 
 
377 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.06 
 
 
380 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.04 
 
 
360 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.91 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.89 
 
 
378 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  29.97 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  29.09 
 
 
365 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.97 
 
 
364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  29.09 
 
 
364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  29.87 
 
 
363 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  29.09 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  28.57 
 
 
364 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  30.39 
 
 
363 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  28.57 
 
 
364 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.56 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.35 
 
 
363 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.29 
 
 
326 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.72 
 
 
355 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.72 
 
 
355 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.16 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.06 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.12 
 
 
360 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  33.78 
 
 
317 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.74 
 
 
313 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.93 
 
 
321 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  30.21 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  28 
 
 
323 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.96 
 
 
354 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.6 
 
 
319 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  31.63 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.76 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.56 
 
 
315 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.94 
 
 
316 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.48 
 
 
366 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.69 
 
 
362 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.36 
 
 
353 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.15 
 
 
316 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.02 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.08 
 
 
359 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.09 
 
 
361 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.43 
 
 
354 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.76 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.96 
 
 
314 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.42 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.96 
 
 
314 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.07 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  37.74 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.51 
 
 
354 aa  97.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  38 
 
 
318 aa  96.3  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.22 
 
 
363 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.38 
 
 
319 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.07 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.13 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.43 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.21 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  26.73 
 
 
359 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.85 
 
 
349 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.1 
 
 
361 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.33 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0489  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.1 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.87 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0500  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.1 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0511  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.1 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.21 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.85 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.12 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>