More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11566 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  750    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.24 
 
 
383 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.88 
 
 
369 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  59.74 
 
 
383 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  54.21 
 
 
370 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  54.64 
 
 
378 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.56 
 
 
376 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.93 
 
 
374 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.64 
 
 
376 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.93 
 
 
374 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.19 
 
 
374 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.31 
 
 
377 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.55 
 
 
378 aa  339  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.82 
 
 
378 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  47.34 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.28 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.28 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.28 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.47 
 
 
367 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.13 
 
 
373 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.42 
 
 
377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.48 
 
 
376 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.95 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.47 
 
 
373 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.49 
 
 
375 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.3 
 
 
378 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.69 
 
 
373 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.69 
 
 
373 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.69 
 
 
373 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.18 
 
 
372 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.43 
 
 
373 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.65 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.21 
 
 
371 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.77 
 
 
377 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.15 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.52 
 
 
363 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.87 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  30.75 
 
 
363 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.67 
 
 
378 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  31.27 
 
 
364 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.27 
 
 
364 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  30.75 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.01 
 
 
364 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  30.75 
 
 
365 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.94 
 
 
363 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  30.23 
 
 
364 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.71 
 
 
331 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  30.23 
 
 
364 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.2 
 
 
380 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.41 
 
 
355 aa  143  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.41 
 
 
355 aa  143  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.39 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.37 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.06 
 
 
323 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.97 
 
 
314 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.97 
 
 
314 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.38 
 
 
317 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  29.19 
 
 
346 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.98 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.69 
 
 
313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.33 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.68 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.55 
 
 
326 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.33 
 
 
319 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.13 
 
 
317 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.19 
 
 
316 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.44 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  30.16 
 
 
321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  26.7 
 
 
321 aa  113  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 
350 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.79 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.62 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.19 
 
 
316 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.67 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.23 
 
 
356 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.31 
 
 
316 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.67 
 
 
358 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
356 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  33.47 
 
 
311 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.69 
 
 
313 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.87 
 
 
359 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.7 
 
 
319 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.31 
 
 
363 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.66 
 
 
362 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.89 
 
 
321 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  29.57 
 
 
350 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.29 
 
 
326 aa  103  5e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  37.89 
 
 
318 aa  103  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  26.06 
 
 
355 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.75 
 
 
309 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  28.96 
 
 
355 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  28.27 
 
 
409 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.21 
 
 
354 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
353 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.13 
 
 
311 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  32.81 
 
 
368 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.22 
 
 
361 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>