More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3815 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
367 aa  736    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.21 
 
 
367 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.19 
 
 
373 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.19 
 
 
373 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69 
 
 
373 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.65 
 
 
373 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  66.49 
 
 
378 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.73 
 
 
373 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  68.68 
 
 
373 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.58 
 
 
373 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.26 
 
 
376 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.15 
 
 
369 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  51.48 
 
 
370 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  46.26 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.34 
 
 
376 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.81 
 
 
376 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.81 
 
 
376 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.81 
 
 
376 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.68 
 
 
377 aa  292  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  47.26 
 
 
383 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.85 
 
 
383 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.15 
 
 
374 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.15 
 
 
374 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.15 
 
 
374 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  46.95 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.11 
 
 
375 aa  268  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.32 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  44.5 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.74 
 
 
378 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.21 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.41 
 
 
372 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.31 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.2 
 
 
371 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.64 
 
 
377 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.93 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.36 
 
 
360 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.21 
 
 
380 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.7 
 
 
315 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.62 
 
 
331 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  29.89 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.87 
 
 
378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  29.32 
 
 
364 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  29.06 
 
 
364 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.69 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.69 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.03 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  28.98 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.39 
 
 
363 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.72 
 
 
364 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  29.63 
 
 
363 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.45 
 
 
313 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  28.72 
 
 
364 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  28.72 
 
 
364 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.72 
 
 
364 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.14 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  31.04 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  30.81 
 
 
346 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.53 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.68 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.98 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.75 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.57 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  27.75 
 
 
321 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.07 
 
 
309 aa  110  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.17 
 
 
323 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.07 
 
 
319 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.61 
 
 
345 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.17 
 
 
354 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.95 
 
 
311 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.98 
 
 
321 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  28.2 
 
 
323 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.57 
 
 
360 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.3 
 
 
325 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  28.98 
 
 
311 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.78 
 
 
318 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.32 
 
 
357 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.33 
 
 
352 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.58 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28.08 
 
 
323 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.41 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.06 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  31.21 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.61 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.77 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.19 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.47 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.85 
 
 
317 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.36 
 
 
378 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.5 
 
 
361 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.05 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  27.11 
 
 
409 aa  92.8  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.53 
 
 
314 aa  92.8  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.07 
 
 
342 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  29.61 
 
 
368 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.36 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.42 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.62 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>