More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2638 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 373 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  87.05 
 
 		 373 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.58 
 
 		 367 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.27 
 
 		 378 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.49 
 
 		 367 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.27 
 
 		 373 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.78 
 
 		 373 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.27 
 
 		 373 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.78 
 
 		 373 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63 
 
 		 373 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.87 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.07 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  53.35 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  50.8 
 
 		 383 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.29 
 
 		 377 aa  299  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  46.46 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.37 
 
 		 376 aa  292  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.98 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.98 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.98 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.24 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.24 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.24 
 
 		 374 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.34 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  49.47 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  47.23 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.55 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.63 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.73 
 
 		 376 aa  262  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.78 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.6 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.43 
 
 		 372 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.05 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.22 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.15 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.79 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.04 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.15 
 
 		 331 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  35.89 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.76 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.76 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  28.31 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  26.79 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  27.54 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.75 
 
 		 315 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.28 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.51 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  27.27 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  27.27 
 
 		 364 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  26.86 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  26.86 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.45 
 
 		 313 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  26.47 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  27.78 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  33.62 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.24 
 
 		 316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.93 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  29.43 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.15 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.87 
 
 		 345 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.69 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.87 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.6 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  38.58 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.48 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.68 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.71 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  29.04 
 
 		 350 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.87 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.78 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.36 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  28.22 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.94 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.59 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.3 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  27.72 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.2 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.2 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.36 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.5 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.3 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.77 
 
 		 309 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.77 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  28.87 
 
 		 409 aa  99.8  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.96 
 
 		 326 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.61 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.75 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.11 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.34 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.59 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.36 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  27.85 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.7 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.49 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  30.45 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  31.54 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.93 
 
 		 349 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.98 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.2 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>