More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6298 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 372 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  76.01 
 
 		 371 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  44.68 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.3 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.89 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  40.48 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.38 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.48 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.85 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.85 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.27 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.85 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  42.18 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.58 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.58 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.58 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.79 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.21 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.27 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.01 
 
 		 373 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.01 
 
 		 373 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.95 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.41 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.22 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.42 
 
 		 376 aa  242  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.53 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.01 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.01 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.13 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.42 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  40.05 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.27 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.43 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.37 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.83 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.79 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  28.06 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  28.39 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  27.5 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.02 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.13 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  27.86 
 
 		 365 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  27.86 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  27.58 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  27.58 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  27.86 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.37 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.21 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.06 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.92 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.92 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.35 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.74 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  27.27 
 
 		 355 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  27.27 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  30.89 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.46 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.83 
 
 		 313 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.27 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.57 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  28.53 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  27.22 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.33 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.44 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.34 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.46 
 
 		 357 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.52 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.81 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.96 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.84 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.82 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.94 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.75 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.27 
 
 		 325 aa  90.5  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  23.53 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  30.9 
 
 		 321 aa  90.5  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  28.21 
 
 		 409 aa  89.4  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.49 
 
 		 313 aa  89.4  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.84 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.84 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.31 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.58 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.44 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.11 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.1 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.1 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.24 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  28.53 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.1 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  23.58 
 
 		 316 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.83 
 
 		 353 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  25.38 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.74 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.74 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.05 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.08 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.49 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.44 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3091  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.01 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>