More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2724 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
367 aa  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.21 
 
 
367 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.87 
 
 
378 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.01 
 
 
373 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.28 
 
 
373 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.01 
 
 
373 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  67.21 
 
 
373 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  67.12 
 
 
373 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.58 
 
 
373 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  65.49 
 
 
373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.56 
 
 
369 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.85 
 
 
376 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  51.35 
 
 
370 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  47.09 
 
 
376 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.89 
 
 
377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.76 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  48.69 
 
 
383 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.19 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.19 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.19 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  49.47 
 
 
375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.32 
 
 
374 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.32 
 
 
374 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.32 
 
 
374 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.34 
 
 
383 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44 
 
 
378 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.77 
 
 
375 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  44.5 
 
 
378 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.67 
 
 
376 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.06 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.53 
 
 
372 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.35 
 
 
371 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.31 
 
 
378 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.29 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.99 
 
 
380 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.82 
 
 
360 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.65 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.25 
 
 
380 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.69 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  29.29 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.05 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  28.23 
 
 
364 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  27.11 
 
 
364 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.25 
 
 
323 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  29.02 
 
 
363 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.97 
 
 
378 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.88 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  28.97 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.11 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  26.25 
 
 
364 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  25.98 
 
 
365 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.7 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  25.72 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.94 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.94 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  25.72 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  31.76 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.01 
 
 
316 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.53 
 
 
314 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.53 
 
 
314 aa  116  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.47 
 
 
316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.6 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  25.46 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.76 
 
 
354 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.99 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  25.95 
 
 
321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.2 
 
 
345 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.78 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.38 
 
 
363 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.66 
 
 
356 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.69 
 
 
319 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.49 
 
 
360 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  30.29 
 
 
311 aa  106  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.04 
 
 
318 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  30 
 
 
350 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.72 
 
 
309 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.97 
 
 
319 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.59 
 
 
358 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  31.19 
 
 
368 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  27.08 
 
 
323 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  29.79 
 
 
409 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.12 
 
 
311 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.16 
 
 
325 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.69 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.03 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.87 
 
 
320 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.41 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  26.04 
 
 
323 aa  96.7  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.64 
 
 
313 aa  96.3  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.27 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.87 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.26 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.8 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.84 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  31.58 
 
 
355 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.93 
 
 
354 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.23 
 
 
364 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.16 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.6 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.43 
 
 
314 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>