More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1182 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
322 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  45.19 
 
 
324 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.49 
 
 
331 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.99 
 
 
328 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.49 
 
 
331 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.49 
 
 
324 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.49 
 
 
324 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.49 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.04 
 
 
328 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.38 
 
 
328 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.85 
 
 
335 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.94 
 
 
325 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.44 
 
 
323 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.89 
 
 
332 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.22 
 
 
324 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.72 
 
 
325 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.81 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  44.59 
 
 
334 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.67 
 
 
326 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.44 
 
 
342 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.03 
 
 
326 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.99 
 
 
325 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.19 
 
 
330 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.03 
 
 
327 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.35 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.13 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.87 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.87 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.87 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.98 
 
 
328 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.17 
 
 
328 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.73 
 
 
329 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  42.17 
 
 
328 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.51 
 
 
323 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.94 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.99 
 
 
334 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.8 
 
 
323 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.48 
 
 
330 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.19 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.61 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.82 
 
 
324 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.42 
 
 
325 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.3 
 
 
339 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.04 
 
 
327 aa  208  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08801  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09600)  39.69 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.196554  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29975  predicted protein  37.7 
 
 
346 aa  179  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.66 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03300  2-nitropropane dioxygenase, putative  33.23 
 
 
340 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.37 
 
 
326 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  36.57 
 
 
321 aa  165  8e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.33 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.62 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.72 
 
 
319 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.63 
 
 
323 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.08 
 
 
313 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6837  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.54 
 
 
330 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2605  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.2 
 
 
342 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152274  normal  0.24366 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.63 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.16 
 
 
314 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.01 
 
 
316 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.06 
 
 
325 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.01 
 
 
316 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.07 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.03 
 
 
319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.11 
 
 
311 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  33.86 
 
 
317 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.91 
 
 
336 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.38 
 
 
356 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.57 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.63 
 
 
326 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  32.19 
 
 
311 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  31 
 
 
326 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.1 
 
 
369 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
356 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
356 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
356 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  33.12 
 
 
321 aa  143  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1729  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.33 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.66 
 
 
351 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.86 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.44 
 
 
309 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  33.14 
 
 
355 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
316 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.15 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.38 
 
 
320 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.74 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04811  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336266  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.58 
 
 
317 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.26 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.95 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.95 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.69 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.35 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.05 
 
 
354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.69 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.45 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.2 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2734  putative 2-nitropropane dioxygenase  30.54 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  31.72 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>