More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2157 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2157  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
384 aa  792    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.16 
 
 
362 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1561  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.48 
 
 
360 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.2 
 
 
354 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.14 
 
 
369 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.69 
 
 
353 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.25 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.69 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.85 
 
 
356 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.11 
 
 
356 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.11 
 
 
356 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.11 
 
 
356 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.43 
 
 
356 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  44.57 
 
 
355 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.65 
 
 
354 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.893392  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3984  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.32 
 
 
361 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.7 
 
 
351 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2746  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.17 
 
 
362 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.881958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.78 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1378  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.25 
 
 
356 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36272  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37.08 
 
 
326 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.6 
 
 
315 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.05 
 
 
319 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.31 
 
 
323 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.47 
 
 
355 aa  146  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.97 
 
 
313 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  29.53 
 
 
317 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.26 
 
 
316 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.61 
 
 
319 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.78 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  30.42 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  29.88 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.18 
 
 
328 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.08 
 
 
316 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.29 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.75 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.77 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.94 
 
 
324 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.05 
 
 
319 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  29.14 
 
 
321 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.16 
 
 
319 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.29 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.19 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.8 
 
 
331 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.71 
 
 
342 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.25 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.25 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.1 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.09 
 
 
328 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.03 
 
 
331 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.31 
 
 
331 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.95 
 
 
309 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.32 
 
 
328 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.02 
 
 
332 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  29.94 
 
 
311 aa  123  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.35 
 
 
313 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.49 
 
 
355 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.49 
 
 
355 aa  123  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.89 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.84 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.58 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.3 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.15 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.3 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.53 
 
 
316 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28.4 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.44 
 
 
335 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.86 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.49 
 
 
330 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.99 
 
 
326 aa  119  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.15 
 
 
317 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.81 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.67 
 
 
325 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.86 
 
 
334 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  31.82 
 
 
334 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.26 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.26 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.26 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.06 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  28.99 
 
 
318 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.04 
 
 
345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.32 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  28.02 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.71 
 
 
323 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.19 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.42 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.58 
 
 
492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.5 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1854  hypothetical protein  31.76 
 
 
316 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0198092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.7 
 
 
311 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  25.92 
 
 
348 aa  108  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.68 
 
 
324 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.92 
 
 
360 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.41 
 
 
506 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.5 
 
 
326 aa  107  5e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.88 
 
 
316 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.82 
 
 
327 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  35.89 
 
 
328 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.22 
 
 
313 aa  106  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.92 
 
 
492 aa  106  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>