More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3114 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 492 aa  971    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  98.37 
 
 		 506 aa  958    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.46 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.04 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.74 
 
 		 341 aa  287  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.37 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1141  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.14 
 
 		 338 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.487634  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.86 
 
 		 329 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.66 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  33.54 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6379  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.74 
 
 		 277 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.33 
 
 		 345 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3758  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.89 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.05 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.15 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.89 
 
 		 323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.28 
 
 		 315 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3158  hypothetical protein  49.03 
 
 		 163 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.616867  normal  0.429528 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.79 
 
 		 360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.51 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.19 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.63 
 
 		 316 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1503  hypothetical protein  47.33 
 
 		 168 aa  124  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.62 
 
 		 321 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.59 
 
 		 386 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.93 
 
 		 323 aa  123  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.25 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.25 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  30.33 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.43 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.93 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.6 
 
 		 324 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.42 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.39 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  32.3 
 
 		 311 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  37.1 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.89 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.2 
 
 		 324 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 		 328 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.73 
 
 		 328 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.2 
 
 		 324 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.13 
 
 		 323 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.85 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.11 
 
 		 324 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.28 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.35 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.87 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.33 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.69 
 
 		 366 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.53 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.53 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.5 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.82 
 
 		 342 aa  113  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.29 
 
 		 315 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0035  hypothetical protein  48.72 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  37.59 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.59 
 
 		 313 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.55 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.18 
 
 		 355 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.78 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.02 
 
 		 323 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.78 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.09 
 
 		 353 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.78 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.26 
 
 		 319 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.08 
 
 		 341 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.92 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.92 
 
 		 356 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.52 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.53 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.03 
 
 		 309 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.76 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.33 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.07 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.07 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.07 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.25 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.92 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.73 
 
 		 327 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  27.84 
 
 		 363 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.79 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.88 
 
 		 378 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.97 
 
 		 311 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.28 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  27.45 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.51 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.7 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.23 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.68 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.27 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.31 
 
 		 324 aa  104  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.58 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.83 
 
 		 320 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  27.1 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2806  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.13 
 
 		 353 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180087  decreased coverage  0.0002175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  34.28 
 
 		 323 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  26.83 
 
 		 364 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  27.17 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>