42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4239 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  100 
 
 
539 aa  1077    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  54.78 
 
 
530 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  50.39 
 
 
542 aa  485  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.2 
 
 
552 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.44 
 
 
541 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  45.28 
 
 
549 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  52.78 
 
 
554 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  47.83 
 
 
542 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.22 
 
 
554 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.3 
 
 
525 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  52.56 
 
 
554 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  47.88 
 
 
545 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  50.98 
 
 
557 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.17 
 
 
542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.21 
 
 
545 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.43 
 
 
550 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  46.79 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  49.28 
 
 
556 aa  462  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.53 
 
 
554 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  50.55 
 
 
537 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  45.57 
 
 
548 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  45.57 
 
 
548 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  50 
 
 
548 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  45.57 
 
 
548 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.78 
 
 
550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.9 
 
 
548 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.57 
 
 
552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  45.86 
 
 
542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  51.56 
 
 
477 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  44.27 
 
 
531 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  45.65 
 
 
532 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.33 
 
 
553 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  48.52 
 
 
526 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  50.86 
 
 
550 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  48.17 
 
 
865 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  42.95 
 
 
481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.46 
 
 
764 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  37.95 
 
 
803 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  39.56 
 
 
1154 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  34.05 
 
 
790 aa  266  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.01 
 
 
363 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5043  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.74 
 
 
345 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>