75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4451 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  100 
 
 
549 aa  1139    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.08 
 
 
548 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.74 
 
 
542 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.57 
 
 
550 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.76 
 
 
550 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  57.74 
 
 
542 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.37 
 
 
545 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.28 
 
 
525 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.95 
 
 
552 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.84 
 
 
541 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  71.32 
 
 
556 aa  784    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  58.7 
 
 
547 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  58.48 
 
 
548 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  56.69 
 
 
545 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  58.48 
 
 
548 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.48 
 
 
552 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  58.48 
 
 
548 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  58.29 
 
 
548 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  56.49 
 
 
542 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  57.14 
 
 
537 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  53.66 
 
 
531 aa  592  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  53.93 
 
 
532 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  51.07 
 
 
542 aa  530  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.6 
 
 
553 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  47.46 
 
 
526 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  45.35 
 
 
557 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  45.42 
 
 
554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.93 
 
 
554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.26 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  46.35 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  45.44 
 
 
554 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  48.99 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  45.28 
 
 
539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  46.43 
 
 
530 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  45.89 
 
 
803 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  44.75 
 
 
481 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.42 
 
 
764 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  42.35 
 
 
1154 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  42.17 
 
 
865 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  38.51 
 
 
790 aa  333  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.93 
 
 
329 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.82 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.68 
 
 
363 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.26 
 
 
363 aa  53.9  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.84 
 
 
378 aa  53.5  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  25.1 
 
 
317 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.1 
 
 
360 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  39.74 
 
 
364 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  39.74 
 
 
364 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  38.46 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  38.46 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  38.46 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  23.77 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.57 
 
 
331 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  39.68 
 
 
363 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  23.22 
 
 
316 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  38.46 
 
 
364 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  39.68 
 
 
363 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.96 
 
 
353 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.57 
 
 
346 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.66 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  37.18 
 
 
364 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  26.23 
 
 
355 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.45 
 
 
316 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.44 
 
 
323 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.65 
 
 
357 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.99 
 
 
361 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.82 
 
 
350 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1493  putative 2-nitropropane dioxygenase  33.77 
 
 
157 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.1 
 
 
346 aa  44.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  26.44 
 
 
350 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.51 
 
 
359 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.26 
 
 
372 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.83 
 
 
492 aa  43.5  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.44 
 
 
353 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>