41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2669 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  88.63 
 
 		 548 aa  1012    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  58.76 
 
 		 549 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  88.09 
 
 		 548 aa  1007    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  80.99 
 
 		 545 aa  934    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  88.63 
 
 		 548 aa  1012    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  81.35 
 
 		 542 aa  924    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.44 
 
 		 541 aa  925    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  62.57 
 
 		 532 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  89.17 
 
 		 552 aa  1014    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  81.8 
 
 		 545 aa  921    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  88.09 
 
 		 548 aa  1006    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  63.79 
 
 		 531 aa  699    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  73.83 
 
 		 537 aa  793    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  98.55 
 
 		 548 aa  1117    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  95.32 
 
 		 547 aa  1080    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  86.37 
 
 		 542 aa  964    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 550 aa  1137    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  98.18 
 
 		 550 aa  1118    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  83.03 
 
 		 542 aa  950    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.35 
 
 		 552 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  57.3 
 
 		 556 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.58 
 
 		 525 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  53.76 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  48.01 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  53.28 
 
 		 554 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.39 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  50.1 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  50.68 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  49.81 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.57 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  53.64 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.42 
 
 		 554 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 		 530 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  49.78 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.16 
 
 		 764 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  42.98 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  44.24 
 
 		 865 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  43.81 
 
 		 803 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  43.12 
 
 		 1154 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  39.04 
 
 		 790 aa  329  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.82 
 
 		 363 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>