More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2587 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  100 
 
 		 865 aa  1733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  38.64 
 
 		 803 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.32 
 
 		 764 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  50.79 
 
 		 481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  50.45 
 
 		 1154 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  45.11 
 
 		 548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  44.67 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.67 
 
 		 552 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  44.67 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  44.67 
 
 		 548 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  43.57 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.49 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.49 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  44.2 
 
 		 542 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  44.04 
 
 		 545 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.82 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  45 
 
 		 542 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  43.29 
 
 		 547 aa  393  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.04 
 
 		 541 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.41 
 
 		 542 aa  389  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.37 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  43.37 
 
 		 542 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  46.24 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  44.37 
 
 		 477 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  42.17 
 
 		 549 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.2 
 
 		 554 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.37 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  41.15 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  48.62 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  41.5 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  43.86 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.89 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.14 
 
 		 525 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  42.31 
 
 		 790 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  43.15 
 
 		 554 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  43.95 
 
 		 530 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.61 
 
 		 553 aa  360  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  41 
 
 		 556 aa  358  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  45.88 
 
 		 539 aa  353  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  41.67 
 
 		 526 aa  333  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.5 
 
 		 2284 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3093  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.74 
 
 		 410 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4311  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  46.85 
 
 		 1055 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2616  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.24 
 
 		 390 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0488176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1389  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.24 
 
 		 390 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1475  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.24 
 
 		 437 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00398178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1434  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.08 
 
 		 377 aa  248  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1209  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  47.89 
 
 		 394 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.059657  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0451  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  47.89 
 
 		 452 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0265499  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1125  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  47.89 
 
 		 452 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0174  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  47.89 
 
 		 452 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286523  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2098  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  46.67 
 
 		 299 aa  238  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.476029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1433  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  46.97 
 
 		 623 aa  217  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.77 
 
 		 309 aa  211  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0839  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.53 
 
 		 299 aa  211  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0428  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.53 
 
 		 299 aa  211  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1458  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.53 
 
 		 299 aa  211  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1850  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.53 
 
 		 299 aa  211  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.53 
 
 		 299 aa  211  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.582901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0524  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.16 
 
 		 299 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0641  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.33 
 
 		 313 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000153814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2986  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.41 
 
 		 319 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0669081  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2602  putative acyltransferase  41.26 
 
 		 282 aa  195  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2512  putative acyltransferase  41.26 
 
 		 282 aa  195  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2015  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.58 
 
 		 293 aa  191  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3992  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.53 
 
 		 297 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1804  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.39 
 
 		 290 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1644  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.55 
 
 		 309 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1832  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.03 
 
 		 290 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2387  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.35 
 
 		 298 aa  184  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1158  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  36.96 
 
 		 301 aa  182  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00125697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3951  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.03 
 
 		 314 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1044  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.22 
 
 		 299 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00926086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3900  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.7 
 
 		 314 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3593  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.7 
 
 		 314 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3611  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.7 
 
 		 314 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1292  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.38 
 
 		 314 aa  181  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.785479  hitchhiker  0.0000000000409846 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01511  malonyl coenzyme A-acyl carrier protein transacylase  40.43 
 
 		 300 aa  180  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3469  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.07 
 
 		 324 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122116  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0168  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.73 
 
 		 302 aa  179  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3894  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.38 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14091  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0305  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.35 
 
 		 298 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0957  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.99 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.915141  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2977  putative acyltransferase  40.23 
 
 		 264 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  hitchhiker  0.0000388716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3675  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.91 
 
 		 314 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0879975  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2491  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  39.37 
 
 		 302 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3866  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.38 
 
 		 314 aa  178  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3239299999999998e-45 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2566  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.87 
 
 		 304 aa  178  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1289  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.24 
 
 		 308 aa  177  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.899199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1314  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.24 
 
 		 308 aa  177  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1971  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.91 
 
 		 313 aa  177  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0128  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  36.3 
 
 		 293 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0130  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  36.3 
 
 		 293 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3703  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.05 
 
 		 314 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2730  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  41.09 
 
 		 292 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0711  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.6 
 
 		 307 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000405607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3990  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.05 
 
 		 314 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1456  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.12 
 
 		 293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  0.0451316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0013  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.06 
 
 		 306 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0611  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  34.63 
 
 		 299 aa  174  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000665754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>