40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3205 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  82.34 
 
 		 548 aa  936    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  56.84 
 
 		 549 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  82.34 
 
 		 548 aa  937    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  92.84 
 
 		 545 aa  1058    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  82.34 
 
 		 548 aa  936    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  92.8 
 
 		 542 aa  1048    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 541 aa  1123    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  64.79 
 
 		 532 aa  721    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  81.97 
 
 		 552 aa  929    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  84.4 
 
 		 545 aa  969    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  81.97 
 
 		 548 aa  936    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  64.47 
 
 		 531 aa  707    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  71.75 
 
 		 537 aa  781    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.73 
 
 		 548 aa  927    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  81.26 
 
 		 547 aa  922    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.5 
 
 		 552 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  80.26 
 
 		 542 aa  921    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.44 
 
 		 550 aa  925    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.8 
 
 		 550 aa  928    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  82.07 
 
 		 542 aa  935    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  57.17 
 
 		 556 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.22 
 
 		 525 aa  618  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  54.62 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  57.14 
 
 		 554 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  56.49 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  50.88 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.89 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  55.51 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.33 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  50.89 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  51.18 
 
 		 550 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.36 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  48.44 
 
 		 539 aa  458  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  49.46 
 
 		 530 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.74 
 
 		 764 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  44.34 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  44.19 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  44.47 
 
 		 865 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  43.15 
 
 		 1154 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  37.09 
 
 		 790 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>