42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1597 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  81.26 
 
 		 541 aa  922    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  58.7 
 
 		 549 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  89.58 
 
 		 548 aa  1014    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  81.37 
 
 		 545 aa  929    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  90.13 
 
 		 548 aa  1018    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  82.19 
 
 		 542 aa  928    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  63.12 
 
 		 532 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  90.13 
 
 		 548 aa  1018    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  90.68 
 
 		 552 aa  1023    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  81.48 
 
 		 545 aa  914    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  89.58 
 
 		 548 aa  1013    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  64.57 
 
 		 531 aa  700    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  73.26 
 
 		 537 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  96.02 
 
 		 548 aa  1087    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1128    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.24 
 
 		 552 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  88.37 
 
 		 542 aa  972    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  95.32 
 
 		 550 aa  1080    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  96.04 
 
 		 550 aa  1088    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  84.73 
 
 		 542 aa  950    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  57.78 
 
 		 556 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.92 
 
 		 525 aa  614  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  53.55 
 
 		 542 aa  520  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  48.81 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  47.79 
 
 		 557 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.02 
 
 		 553 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  51.08 
 
 		 550 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  48.26 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  51.47 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48 
 
 		 554 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  53.64 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.38 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  50 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  46.79 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.86 
 
 		 764 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  42.98 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  44.47 
 
 		 865 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  44.04 
 
 		 803 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  43.34 
 
 		 1154 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  38.58 
 
 		 790 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.19 
 
 		 363 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.59 
 
 		 369 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>