40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2630 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  87.5 
 
 		 548 aa  966    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  57.74 
 
 		 549 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  86.94 
 
 		 548 aa  962    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  80.37 
 
 		 545 aa  926    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  87.5 
 
 		 548 aa  966    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  81.18 
 
 		 542 aa  928    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  80.26 
 
 		 541 aa  921    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  64.33 
 
 		 532 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  87.5 
 
 		 552 aa  965    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  81 
 
 		 545 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  87.31 
 
 		 548 aa  968    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  64.38 
 
 		 531 aa  695    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  72.18 
 
 		 537 aa  769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  87.25 
 
 		 548 aa  970    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  88.37 
 
 		 547 aa  972    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.07 
 
 		 552 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1125    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.37 
 
 		 550 aa  964    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.95 
 
 		 550 aa  970    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  88.17 
 
 		 542 aa  996    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  58.89 
 
 		 556 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.77 
 
 		 525 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  52.04 
 
 		 542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  51.83 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  51.06 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.15 
 
 		 553 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  49.81 
 
 		 550 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  48.32 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.9 
 
 		 554 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  50 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  52.83 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.58 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  49.28 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  45.86 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.79 
 
 		 764 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  44.27 
 
 		 803 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  42.32 
 
 		 481 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  43.78 
 
 		 865 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  41.53 
 
 		 1154 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  37.44 
 
 		 790 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>