267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0933 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0933  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 328 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5249  basic membrane lipoprotein  31.15 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  30.39 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  26.22 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3674  basic membrane lipoprotein  26.53 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  26.73 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  30.03 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  27.18 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  29.69 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  26.07 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  27.08 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4008  basic membrane lipoprotein  25.84 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  29.07 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  25.42 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  27.9 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  28.75 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  26.25 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  25.53 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  24.1 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  24.54 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  24.25 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  24.75 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  26.16 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1305  basic membrane lipoprotein  28.82 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  28.24 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  26.44 
 
 		 356 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4148  basic membrane lipoprotein  31.06 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  25.83 
 
 		 385 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  25.91 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  28.81 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  24.75 
 
 		 385 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  25 
 
 		 713 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  23.67 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  28.38 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  26.09 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.34 
 
 		 364 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  25.58 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  28.51 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  24.92 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3310  basic membrane lipoprotein  28.29 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  24.24 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  25.84 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  26.91 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  24.09 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  22.88 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  25.72 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  24.75 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  26.28 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0951  basic membrane lipoprotein  27.3 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  24.45 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  26.67 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  23.48 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  25.62 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  25.57 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  27.61 
 
 		 354 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  24.83 
 
 		 390 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  25.19 
 
 		 329 aa  86.3  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1948  putative basic membrane protein  27.34 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00107991  hitchhiker  0.0000839366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  25.23 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.05 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  24.35 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6360  basic membrane lipoprotein  32.96 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521403  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.77 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  25.16 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  26.58 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  22.37 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  25.77 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  26.81 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  22.92 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  25.88 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6181  basic membrane lipoprotein  32.4 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  normal  0.349116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  23.2 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5270  hypothetical protein  26.88 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401628  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  25.75 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  24.34 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  28.82 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  24.69 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  25.79 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  24.76 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  25.25 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  26.79 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  25.69 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5338  basic membrane lipoprotein  28.16 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  24.69 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  22.73 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  24.84 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  25.95 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  25.58 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  23.99 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  26.35 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  24.35 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  24.84 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  24.62 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  22.26 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  23.99 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>