291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2769 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 342 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  35.33 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 383 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  32.62 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  33.67 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  31.16 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  33.54 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  34 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  32.83 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  35 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  33.44 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  33.89 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  31.1 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  32.42 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  29.91 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  31.21 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  32.07 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  31.67 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  32.57 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  31.02 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2932  basic membrane lipoprotein  32.04 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  31.02 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  30.31 
 
 		 362 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  27.81 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  32.83 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  30.2 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  32.92 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  29.02 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  34.24 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  30.87 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  33 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  30.74 
 
 		 382 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  35.16 
 
 		 386 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3674  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  32.27 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  33.92 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.44 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  32.67 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  30.42 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  28.22 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  30.33 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  33.23 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3191  basic membrane lipoprotein  33.82 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  30.56 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  30.2 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  28.44 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.28 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  27.35 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  30.28 
 
 		 373 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1948  putative basic membrane protein  30.83 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00107991  hitchhiker  0.0000839366 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  28.23 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  27.24 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  31.08 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0951  basic membrane lipoprotein  32.71 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  29.86 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  29.86 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4008  basic membrane lipoprotein  32.39 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  30.64 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  28.07 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  30.34 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  29.38 
 
 		 362 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0345  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.23 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.658765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  30.3 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.77 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1989  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  29.89 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  31.06 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  26.32 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  27.95 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  29.37 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  29.79 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  30.36 
 
 		 368 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  28.05 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  30.03 
 
 		 356 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5270  hypothetical protein  30.79 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401628  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  28 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  32.25 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2680  basic membrane lipoprotein  27.91 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000118001  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  29.31 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  30.84 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5338  basic membrane lipoprotein  29.7 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4148  basic membrane lipoprotein  31.09 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0141  Bmp family membrane protein  30.67 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  30.49 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.87 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  28.35 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  28.45 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>