287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3674 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3674  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
355 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  53.24 
 
 
349 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  31.58 
 
 
351 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  33.02 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  30.99 
 
 
360 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  33.1 
 
 
382 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  28.11 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  31.48 
 
 
356 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  30 
 
 
382 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  31.91 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  29.86 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  31.72 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  30.69 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  31.06 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  30.14 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  28.09 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  29.59 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  28.2 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 
335 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  29.54 
 
 
355 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5249  basic membrane lipoprotein  31.37 
 
 
325 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  32.13 
 
 
337 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 
329 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  31.05 
 
 
335 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  30.62 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  29.1 
 
 
357 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  30.16 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  31.54 
 
 
362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  28.24 
 
 
357 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  31.9 
 
 
334 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  27.3 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  29.1 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0933  basic membrane lipoprotein  26.53 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  29.43 
 
 
364 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  26.98 
 
 
358 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  28.23 
 
 
367 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  30.97 
 
 
363 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  31.42 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  26.27 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  29.45 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  28.08 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  27.56 
 
 
363 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  28.62 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  26.3 
 
 
384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  28.53 
 
 
358 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  29.2 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  29.2 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  29.2 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  29.2 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  33.91 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4349  basic membrane lipoprotein  28.25 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494999  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  29.2 
 
 
355 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  27.06 
 
 
364 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  28.48 
 
 
356 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  27.9 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  29.69 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  31.42 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4008  basic membrane lipoprotein  28.04 
 
 
327 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  29.58 
 
 
355 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  28.91 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  28.91 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  28.04 
 
 
361 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  28.47 
 
 
359 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  27.27 
 
 
356 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  29.47 
 
 
361 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  31.91 
 
 
382 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  26.56 
 
 
331 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  27.22 
 
 
382 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1057  hypothetical protein  27.49 
 
 
725 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  32.62 
 
 
386 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  28.07 
 
 
366 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  27.33 
 
 
355 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  26.72 
 
 
327 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  29.19 
 
 
357 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  29.25 
 
 
426 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  27.33 
 
 
358 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.3 
 
 
376 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  29.25 
 
 
426 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 
330 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  25.6 
 
 
365 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  28.23 
 
 
330 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  29.52 
 
 
342 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.11 
 
 
364 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3310  basic membrane lipoprotein  28.81 
 
 
332 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  27.36 
 
 
359 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  27.36 
 
 
359 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  25.34 
 
 
365 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  31.62 
 
 
384 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  30.33 
 
 
353 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 
355 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  26.34 
 
 
431 aa  103  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5338  basic membrane lipoprotein  25.89 
 
 
327 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2932  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 
327 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  27.83 
 
 
346 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6360  basic membrane lipoprotein  31.28 
 
 
328 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521403  normal  0.125495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>