265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6360 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6360  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 328 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521403  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6181  basic membrane lipoprotein  96.95 
 
 		 328 aa  594  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  normal  0.349116 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5270  hypothetical protein  86.59 
 
 		 328 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401628  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5338  basic membrane lipoprotein  85.67 
 
 		 327 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3310  basic membrane lipoprotein  72.29 
 
 		 332 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1305  basic membrane lipoprotein  61.13 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1948  putative basic membrane protein  50.91 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00107991  hitchhiker  0.0000839366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0345  ABC transporter periplasmic-binding protein  48.32 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.658765  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0951  basic membrane lipoprotein  50.65 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  48.53 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1989  basic membrane lipoprotein  48.01 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  49.67 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  48.2 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  46.67 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  45.22 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3191  basic membrane lipoprotein  44.15 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2932  basic membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4148  basic membrane lipoprotein  43.49 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  35.4 
 
 		 385 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  34.34 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  36.45 
 
 		 383 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  33.56 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  34.11 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  34.01 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  34.68 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  32.99 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  32.65 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  32.99 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  31.86 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  32.65 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 373 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  31.4 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  31.42 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  32.53 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  30.69 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  31.86 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  35 
 
 		 377 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  35 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  33.9 
 
 		 376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  31.69 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  34.67 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  31.42 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  33.2 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  32.19 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  32.79 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  35.1 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  33.45 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  31.85 
 
 		 384 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  32.93 
 
 		 368 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  31.87 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  30.21 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  29.87 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  34.6 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 356 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  31.93 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  29.08 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  32.67 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  34.65 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  29.05 
 
 		 364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  29.79 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  28.75 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  29.3 
 
 		 357 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  34.39 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.93 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  29.68 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  32.88 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  32.75 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  31.63 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  28.67 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  32.6 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  31.52 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  32.09 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  30.71 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  33.18 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3674  basic membrane lipoprotein  31.28 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  36.31 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  28.88 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  29.76 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  30.56 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  28.97 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  29.61 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  31.63 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.53 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  35.2 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  30.26 
 
 		 356 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  28.62 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  35.83 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  35.83 
 
 		 426 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  28.23 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>