277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4148 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4148  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 357 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  45.64 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  44.3 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  42.23 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  42.62 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0951  basic membrane lipoprotein  43.89 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  41.95 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1989  basic membrane lipoprotein  41.37 
 
 		 334 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0345  ABC transporter periplasmic-binding protein  41.37 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.658765  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5338  basic membrane lipoprotein  42.47 
 
 		 327 aa  226  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3310  basic membrane lipoprotein  39.51 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1948  putative basic membrane protein  41.16 
 
 		 339 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00107991  hitchhiker  0.0000839366 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5270  hypothetical protein  41.61 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1305  basic membrane lipoprotein  40.74 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6360  basic membrane lipoprotein  43.49 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521403  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3191  basic membrane lipoprotein  41.81 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6181  basic membrane lipoprotein  44.19 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  normal  0.349116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2932  basic membrane lipoprotein  35.82 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  35.83 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  32.64 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  32.73 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  32.72 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  33.21 
 
 		 388 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  35.16 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  33.7 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  31.77 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  32.41 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  30.66 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  33.33 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  33.94 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.95 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  32.72 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  32.37 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  31.85 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  31.3 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  30.42 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  33.7 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  34.17 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  34.98 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  31.17 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  36.15 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  34.6 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  32.32 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  31.94 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  31.65 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  32.44 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  26.74 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  33.99 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  33.46 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  35.87 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  34.17 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  36.05 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  36.05 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  32.16 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  31.62 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  31.71 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  30.8 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  29.5 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  29.35 
 
 		 356 aa  106  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  29.14 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  28.78 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  28.98 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  30.64 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  28.67 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  30.21 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0933  basic membrane lipoprotein  31.06 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  28.57 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  30.8 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.64 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  32.55 
 
 		 713 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  32.02 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  27.91 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  28.21 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  29.25 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  32.66 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  29.53 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  28.68 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  29.11 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  28.91 
 
 		 355 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  29.92 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  30.93 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  30.6 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  27.68 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  32.09 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  27.43 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  26.52 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  31.65 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  30.41 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  30.17 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  26.28 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  30.91 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  30.18 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>