267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3191 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3191  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 335 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  65.16 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0345  ABC transporter periplasmic-binding protein  64.58 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.658765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1989  basic membrane lipoprotein  64.58 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  62.94 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  64.1 
 
 		 329 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1948  putative basic membrane protein  61.01 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00107991  hitchhiker  0.0000839366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  64.59 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0951  basic membrane lipoprotein  64.9 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  62.21 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2932  basic membrane lipoprotein  52.35 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5338  basic membrane lipoprotein  44.79 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5270  hypothetical protein  44.24 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1305  basic membrane lipoprotein  44.58 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6360  basic membrane lipoprotein  45.7 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521403  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6181  basic membrane lipoprotein  43.73 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  normal  0.349116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3310  basic membrane lipoprotein  41.1 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4148  basic membrane lipoprotein  40.06 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  35.14 
 
 		 382 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  33.98 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  33.1 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  31.7 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  34.32 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  32.99 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  38.28 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  34.63 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  31.54 
 
 		 385 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  32.26 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  32.62 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  30.91 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  30.87 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  32.95 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  31.9 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  33.91 
 
 		 388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.07 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  30.37 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  32.79 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  33.82 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  31.23 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  31.45 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  30.82 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  31.42 
 
 		 359 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  33.1 
 
 		 357 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  29.69 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  31.98 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  35.68 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  31 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  30.38 
 
 		 380 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  28.79 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  31.85 
 
 		 386 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.45 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  28.85 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.81 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  30.61 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  29.5 
 
 		 373 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  30.27 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  28.81 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  29.25 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  31.1 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  33.76 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  28.06 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  28.66 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  29.47 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  29.39 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  29.76 
 
 		 387 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  29.63 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  27.1 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  30.41 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  28.9 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  31.11 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  36.13 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  36.13 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  37.08 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  29.55 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  29.04 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  32.32 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  29.53 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  27.14 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  25.91 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  27.53 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  27.16 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  30.23 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  27.21 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  26.92 
 
 		 625 aa  99  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  29.56 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  29.26 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.84 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  26.41 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  27.35 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>