259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1305 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1305  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
327 aa  658    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3310  basic membrane lipoprotein  62.62 
 
 
332 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5338  basic membrane lipoprotein  62.15 
 
 
327 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.440204  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5270  hypothetical protein  60.49 
 
 
328 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401628  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6360  basic membrane lipoprotein  61.13 
 
 
328 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521403  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6181  basic membrane lipoprotein  60.82 
 
 
328 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  normal  0.349116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0345  ABC transporter periplasmic-binding protein  51.52 
 
 
334 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.658765  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1948  putative basic membrane protein  51.23 
 
 
339 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00107991  hitchhiker  0.0000839366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1989  basic membrane lipoprotein  50.91 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0951  basic membrane lipoprotein  52.44 
 
 
334 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  49.83 
 
 
329 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  48.51 
 
 
335 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  45.9 
 
 
334 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  46.53 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  48.51 
 
 
362 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3191  basic membrane lipoprotein  45.03 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2932  basic membrane lipoprotein  40 
 
 
327 aa  256  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4148  basic membrane lipoprotein  40.74 
 
 
357 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  32.99 
 
 
352 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  33.33 
 
 
382 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  32.56 
 
 
368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  32.56 
 
 
382 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  30.82 
 
 
388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  30.82 
 
 
362 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 
384 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  30.27 
 
 
380 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  30.63 
 
 
364 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  33.56 
 
 
373 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  32.28 
 
 
384 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  32.02 
 
 
385 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  30.79 
 
 
385 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  30.46 
 
 
385 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  31.64 
 
 
383 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  30.26 
 
 
382 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  29.8 
 
 
380 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  29.36 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  31.87 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  30.23 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  30.31 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  29.8 
 
 
382 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  35.32 
 
 
366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  29.47 
 
 
380 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  32.03 
 
 
356 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  28.75 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.6 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  31.67 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  29.32 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  25.41 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  29.47 
 
 
381 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.84 
 
 
376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  33.84 
 
 
376 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  30.48 
 
 
385 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  29.11 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  28.48 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  38.43 
 
 
361 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  30.4 
 
 
368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  36.54 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 
360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  30.65 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  28.83 
 
 
355 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  33.18 
 
 
364 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  29.44 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  28.98 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  31.36 
 
 
363 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  30.27 
 
 
365 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.71 
 
 
331 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  29.18 
 
 
361 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  31.12 
 
 
373 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  36.06 
 
 
366 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  30.38 
 
 
363 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  29.41 
 
 
355 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  30.25 
 
 
355 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  30.13 
 
 
357 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  32.03 
 
 
363 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  29.43 
 
 
335 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  28.26 
 
 
364 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  28.72 
 
 
387 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  29.19 
 
 
360 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  30.33 
 
 
376 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 
431 aa  101  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.86 
 
 
364 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  28.93 
 
 
377 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  34.92 
 
 
381 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  30 
 
 
355 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  28.93 
 
 
377 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3674  basic membrane lipoprotein  29.36 
 
 
355 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537913  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  28.93 
 
 
377 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  29.72 
 
 
358 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  27.55 
 
 
364 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  32.8 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  32.8 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0933  basic membrane lipoprotein  28.82 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  29.2 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  31.44 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  33.13 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  27.9 
 
 
382 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  32.26 
 
 
426 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4349  basic membrane lipoprotein  28.69 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494999  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  28.42 
 
 
432 aa  95.9  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.494831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>