280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5249 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5249  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 325 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  32.47 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0933  basic membrane lipoprotein  30.2 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3674  basic membrane lipoprotein  31.6 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  31.09 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  31.3 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  29.28 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  31.7 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  31.7 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  29.18 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  32.58 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  32.21 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  30.3 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  29.63 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  31.18 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.29 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.03 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4008  basic membrane lipoprotein  32.92 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  32.17 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  30.5 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  31.78 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  28.85 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  30.96 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  27.99 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  28 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  28.52 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  27.89 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  26.85 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  29.54 
 
 		 373 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  29.43 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  30.82 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  28.43 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  34.45 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  27.04 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  27.91 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  26.63 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  29.73 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  27.41 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  27.41 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  28.32 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  29.92 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  28.1 
 
 		 355 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  27.3 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  28.01 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  27.76 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  26.85 
 
 		 385 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  28.84 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  26.25 
 
 		 382 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  28.05 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4425  basic membrane lipoprotein  30.48 
 
 		 362 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292066  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  28.05 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  29.05 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  28.79 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  30.14 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  28.48 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  27.1 
 
 		 365 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  30.29 
 
 		 341 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  26.89 
 
 		 382 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  28.62 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 		 382 aa  92.4  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  27.57 
 
 		 386 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  30.32 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  29.64 
 
 		 364 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  34.2 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2660  basic membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00857799  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  26.73 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  26.23 
 
 		 355 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  32.99 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  31 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  26.09 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  32.9 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 426 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 426 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  28.11 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3575  basic membrane lipoprotein  30.85 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  27 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  26.51 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  29.35 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  27.36 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  28.03 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  27.54 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  27.36 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  25.98 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  32.53 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  24.15 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  28.05 
 
 		 390 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  29.05 
 
 		 357 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  28.53 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  28.3 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  27.66 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>