281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0528 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
328 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.62 
 
 
331 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  78.62 
 
 
331 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  72.7 
 
 
331 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  70.12 
 
 
329 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  65.15 
 
 
330 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  67.07 
 
 
331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  60.56 
 
 
330 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  61.44 
 
 
332 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  58.82 
 
 
330 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  58.44 
 
 
339 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  57.28 
 
 
330 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  58.69 
 
 
330 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  56.63 
 
 
330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  50 
 
 
334 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  50.3 
 
 
334 aa  322  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  50.94 
 
 
334 aa  322  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  40.91 
 
 
356 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  43.39 
 
 
337 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  40.8 
 
 
360 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  42.32 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  38.17 
 
 
370 aa  215  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  41.42 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  43.29 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  39.33 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  37.1 
 
 
376 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  38.35 
 
 
377 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  39.56 
 
 
347 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  41.18 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  42.23 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  40.46 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  42.76 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  38.25 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  43.09 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  44.14 
 
 
368 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  36.66 
 
 
341 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  38.57 
 
 
349 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  37.87 
 
 
338 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  40.26 
 
 
350 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  36.81 
 
 
351 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  34.49 
 
 
366 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  38.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  37.62 
 
 
358 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  38.4 
 
 
346 aa  189  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  34.7 
 
 
378 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  41.03 
 
 
382 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  36.69 
 
 
356 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  37.34 
 
 
363 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  38.03 
 
 
566 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  36.51 
 
 
340 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  37.55 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  36.45 
 
 
358 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  34.92 
 
 
363 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  40.07 
 
 
348 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  35.48 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  35.06 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  35.22 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  35.53 
 
 
329 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  34.98 
 
 
354 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  37.2 
 
 
404 aa  163  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  36.21 
 
 
407 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  35.81 
 
 
355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  35.81 
 
 
355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  35.81 
 
 
355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  35.81 
 
 
355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  34.69 
 
 
355 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  35.81 
 
 
355 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  35.81 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  34.94 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  37.2 
 
 
413 aa  162  9e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  35.81 
 
 
355 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  34.42 
 
 
358 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  37.5 
 
 
403 aa  160  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  33.77 
 
 
361 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  33.64 
 
 
389 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  38.97 
 
 
383 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  38.2 
 
 
380 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 
386 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  31.51 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  32.51 
 
 
366 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  31.03 
 
 
359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  31.03 
 
 
359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  33.88 
 
 
366 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  31.19 
 
 
356 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  32.31 
 
 
713 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  32.68 
 
 
330 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  35.02 
 
 
357 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  28.98 
 
 
365 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  36.05 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  32.72 
 
 
331 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  32.55 
 
 
351 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  33.23 
 
 
356 aa  136  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  29.93 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  28.45 
 
 
366 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  34.8 
 
 
356 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  30.89 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.07 
 
 
349 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  31.92 
 
 
377 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  32.5 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  34 
 
 
356 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.281006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>