268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0632 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
330 aa  677    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  62.87 
 
 
334 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  63.5 
 
 
334 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  61.96 
 
 
334 aa  418  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  58.23 
 
 
339 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  60.98 
 
 
330 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  57.01 
 
 
330 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  58.33 
 
 
329 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  55.18 
 
 
330 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  58.77 
 
 
331 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  55.15 
 
 
330 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  53.96 
 
 
330 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.84 
 
 
331 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  57.84 
 
 
331 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  57.19 
 
 
331 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  55.84 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  54.1 
 
 
328 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  45.48 
 
 
360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  46.44 
 
 
337 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  43 
 
 
335 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  39.05 
 
 
370 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  43.58 
 
 
342 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  39.75 
 
 
340 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  40.26 
 
 
356 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  43.43 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  40.59 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  41.37 
 
 
349 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  36.1 
 
 
377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  38.75 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  40.54 
 
 
346 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  42.38 
 
 
347 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  37.97 
 
 
376 aa  215  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  41.75 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  39.67 
 
 
368 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  37.87 
 
 
338 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  34.9 
 
 
366 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  38.61 
 
 
347 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  42.72 
 
 
334 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  36.47 
 
 
329 aa  205  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  36.39 
 
 
357 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  35.07 
 
 
378 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  38.05 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  39.02 
 
 
358 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  40.33 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  37.27 
 
 
340 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  38.69 
 
 
358 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  37.66 
 
 
351 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  38.96 
 
 
354 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  37.94 
 
 
334 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 
389 aa  192  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  37.54 
 
 
413 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  37.38 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  37.95 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  38.36 
 
 
355 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  38.36 
 
 
355 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  38.36 
 
 
355 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  38.36 
 
 
355 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  38.36 
 
 
355 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  40.65 
 
 
327 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  35.51 
 
 
404 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  38.03 
 
 
355 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  38.73 
 
 
363 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  34.79 
 
 
403 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  35.53 
 
 
329 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  38.03 
 
 
355 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  37.38 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  39.93 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  36.9 
 
 
386 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  37.41 
 
 
355 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  33.33 
 
 
365 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  36.7 
 
 
366 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  36.5 
 
 
359 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  36.5 
 
 
359 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  37.78 
 
 
363 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  32.7 
 
 
566 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  34.75 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 
365 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  35.74 
 
 
368 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  33.63 
 
 
380 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  37.79 
 
 
382 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  34.6 
 
 
356 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  32.89 
 
 
356 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  36.82 
 
 
348 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  36.25 
 
 
366 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  35.71 
 
 
357 aa  156  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  31.8 
 
 
713 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  36.5 
 
 
353 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  31.59 
 
 
353 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  34.01 
 
 
377 aa  145  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  31.72 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  30.69 
 
 
322 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  30.97 
 
 
366 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  36.16 
 
 
383 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6254  basic membrane lipoprotein  31.14 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685753  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.08 
 
 
349 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2720  basic membrane lipoprotein  30.25 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  32.53 
 
 
365 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  31.14 
 
 
356 aa  135  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  29.5 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  33.9 
 
 
356 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>