284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0256 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  100 
 
 		 330 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  83.94 
 
 		 330 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  82.73 
 
 		 330 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  65.65 
 
 		 330 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  62.11 
 
 		 329 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  61.36 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  58.23 
 
 		 330 aa  397  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  59.63 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  57.45 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  57.83 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  60 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  54.82 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  55.8 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  57.51 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  57.7 
 
 		 331 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  56.97 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  42.59 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  42.98 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  42.16 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  41.11 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  44.59 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  39.88 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  43.09 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  47.06 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  42.67 
 
 		 347 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  37.04 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  39.86 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  36.69 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  35.76 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  34.65 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  36.63 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  38.92 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  38.92 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  38.92 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  38.92 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  39.24 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  40.14 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  36.98 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  39.16 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  38.61 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  36.56 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  40.89 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  38.8 
 
 		 349 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  38.61 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  42.52 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  39.03 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  35.07 
 
 		 378 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  38.71 
 
 		 358 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 566 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  37.22 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  38.91 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  37.91 
 
 		 361 aa  185  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  34.5 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  39.18 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  37.66 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  37.25 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  38.1 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  34.48 
 
 		 389 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  35.63 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 413 aa  175  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  34.77 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  34.62 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  34.03 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  34.5 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  34.9 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  32.66 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  36.24 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  32.26 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  38.31 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  33.74 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  31.83 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  34.43 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  33.83 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  31.36 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  33.12 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  32.91 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  36.86 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  32.76 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  32.3 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  31.8 
 
 		 713 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  31.37 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  31.37 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  31.83 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  32.96 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  30.86 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2121  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  31.28 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  29.3 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2720  basic membrane lipoprotein  29.43 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  30.32 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.42 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  31.82 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  31.25 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>