233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0142 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 357 aa  717    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  44.1 
 
 		 377 aa  255  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  43.77 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  40.96 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  39.61 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  42.3 
 
 		 358 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  40.29 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  40 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  40.31 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  40.06 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  40.06 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  40.36 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  40.36 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  40.65 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  40.36 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  40.36 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  39.33 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  38.87 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  37.12 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  38.87 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  39.1 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  39.01 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  40.19 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  37.87 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  35.76 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  37.39 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  41.35 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  38.52 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  35.01 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  34.15 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  34.56 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  36.78 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  34.66 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  36.54 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  37.92 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  36.04 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  35.55 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  33.73 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  38.04 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  34.69 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  31.81 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.01 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  32.72 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  37.93 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  34.16 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  37.08 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  31.27 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  34.54 
 
 		 386 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  33.73 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  38.57 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  35.71 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.8 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  33.11 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  34.8 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  34.78 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  32.37 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  32.21 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  31.8 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  32.83 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  33.77 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  31.91 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  35.37 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  33.45 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  36.7 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  33.81 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  34.58 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  31.16 
 
 		 376 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 358 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  32.51 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  32.04 
 
 		 713 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  33.44 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  34.19 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  33.15 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  33.89 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  36.73 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  33.05 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0386  basic membrane protein C (bmpC)  30.75 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  32.52 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  34.8 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  37.74 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  33.45 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  34.07 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  30.11 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  30.55 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  35.02 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  29.31 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  33.23 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  34.6 
 
 		 407 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  36.76 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  31.61 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  35.82 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  32.96 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  33.8 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>