217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1844 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  81.71 
 
 		 404 aa  680    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  88.09 
 
 		 403 aa  665    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 413 aa  830    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  86.68 
 
 		 407 aa  661    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  38.32 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  36.99 
 
 		 335 aa  206  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  40.65 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  38.74 
 
 		 342 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  35.63 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  40.07 
 
 		 347 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  38.92 
 
 		 356 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  37.95 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  37.76 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  41.64 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  39.53 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 353 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  38.31 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  38.33 
 
 		 363 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  37.39 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  37.43 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  36.34 
 
 		 363 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  39.27 
 
 		 330 aa  183  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  40.27 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  39.74 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  36.15 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  39.74 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  35.36 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  32.49 
 
 		 357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  37.39 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  30.95 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  36.13 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 330 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  39.59 
 
 		 355 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  39.59 
 
 		 355 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  39.59 
 
 		 355 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  39.59 
 
 		 355 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  39.59 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  39.14 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  32.41 
 
 		 380 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  39.25 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  39.25 
 
 		 355 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  33.42 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  35.4 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  39.25 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  38.91 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  31.08 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  37.58 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  39.25 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  36.27 
 
 		 331 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  39.94 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  36.24 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.11 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  38.11 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  37.2 
 
 		 328 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  36.14 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  40.94 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  36.58 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  33.44 
 
 		 334 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  35.2 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  32.81 
 
 		 338 aa  156  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  36.66 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  40.12 
 
 		 334 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  37.2 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  37.29 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  36.61 
 
 		 329 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  35.36 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  30.83 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  32.2 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  34.71 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  34.5 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  35.23 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  34.48 
 
 		 713 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  32.46 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  33.89 
 
 		 357 aa  147  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  32.48 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  34.84 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  35.96 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  34.41 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  29.61 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  30.36 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.66 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  29.95 
 
 		 368 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.9 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  30.35 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  33.22 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  32.9 
 
 		 364 aa  132  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  29.47 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  31.21 
 
 		 322 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  32.15 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  31.88 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  32.19 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  33.14 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  36.45 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  30.8 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>