273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0856 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  706    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  59.14 
 
 
349 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  57.88 
 
 
351 aa  381  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  54.89 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  52.15 
 
 
361 aa  315  8e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  50.43 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  45.2 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  46.69 
 
 
363 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  46.18 
 
 
371 aa  265  8.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  43.62 
 
 
358 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  43.32 
 
 
358 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  44.9 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  44.17 
 
 
358 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  42.09 
 
 
355 aa  255  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  42.09 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  42.09 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  42.09 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  42.09 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  42.09 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  42.09 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  40.17 
 
 
357 aa  243  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  41.62 
 
 
377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  35.84 
 
 
356 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  36.78 
 
 
357 aa  187  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  34.17 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  31.75 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  34.96 
 
 
337 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  35.03 
 
 
340 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  34.32 
 
 
356 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  38.67 
 
 
346 aa  159  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  32.58 
 
 
340 aa  159  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  32.77 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  30.59 
 
 
370 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  34.29 
 
 
341 aa  152  8e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  30.77 
 
 
370 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  35.71 
 
 
334 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  33.06 
 
 
354 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  34.34 
 
 
358 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  31.3 
 
 
354 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  34.25 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  31.1 
 
 
360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  33.98 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  35.42 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  34.69 
 
 
386 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  31 
 
 
329 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  33.16 
 
 
358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  33.54 
 
 
347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  30.39 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  33.64 
 
 
350 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  31.17 
 
 
346 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.89 
 
 
331 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  33.79 
 
 
356 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  32.14 
 
 
339 aa  145  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  35.89 
 
 
331 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  29.78 
 
 
357 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
330 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  33.87 
 
 
341 aa  143  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  34.06 
 
 
366 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  31.23 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  35.33 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  35.36 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  33.54 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  35.74 
 
 
407 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  31.29 
 
 
354 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  33.33 
 
 
329 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  30.33 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  31.23 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  31.9 
 
 
330 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  32.07 
 
 
403 aa  135  8e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  32.62 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  31.14 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 
713 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  32.96 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  30.6 
 
 
357 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  31.89 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  32.69 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  33.56 
 
 
328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 
404 aa  133  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 
413 aa  132  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  31.29 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  32.51 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  32.61 
 
 
356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  30.36 
 
 
371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  32.37 
 
 
334 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  30.22 
 
 
380 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  30.91 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  28.35 
 
 
327 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  28.45 
 
 
378 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  30.94 
 
 
322 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  32 
 
 
330 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  29.43 
 
 
353 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  29.71 
 
 
365 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  31.44 
 
 
334 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  29.71 
 
 
359 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  29.71 
 
 
359 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  28.97 
 
 
368 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  28.75 
 
 
330 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  31.05 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>