194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1848 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 357 aa  722    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  47.17 
 
 		 351 aa  276  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  42.9 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  39.34 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  40.17 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  38.5 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  40.06 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  40.17 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  38.55 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  35.1 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  34.81 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  34.81 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  34.81 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  34.81 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  34.51 
 
 		 355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  34.22 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  35.19 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  34.31 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  38.96 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  34.8 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  32.94 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  32.73 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  30.72 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  32.52 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  31.04 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  30.25 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  31.44 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  30.9 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  30.7 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  30.19 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  30.08 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  30.27 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  30.03 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  29.12 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  33.15 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  29.67 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  28.73 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  30.29 
 
 		 370 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  32.52 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  31.7 
 
 		 354 aa  133  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  31.58 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  31.55 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  32.71 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  26.25 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  30.68 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  26.39 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  31.22 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  29.35 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  29.35 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  29.23 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  28.04 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  30.59 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  29.02 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  30.23 
 
 		 713 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  26.78 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  29.71 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  26.19 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  26.54 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  30.08 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  29.73 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  28.97 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  30.85 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  26.89 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  25.78 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  28.04 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  27.9 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  26.65 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  28.79 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  27.53 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  29.06 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  32.3 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  30.07 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  27.97 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  26.7 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  30.45 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  30.22 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  29.7 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  28.87 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  26.74 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  26.83 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  27.64 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  29.55 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  31.32 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  29.8 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  32.81 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  27.91 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  27.5 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  28.47 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  28.7 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.12 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  28.12 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>