271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1320 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 356 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  95.28 
 
 		 356 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  50.48 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  44.17 
 
 		 713 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  35.67 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  35.1 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  37.94 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  36.22 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  34.79 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  35.35 
 
 		 356 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  32.59 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  34.98 
 
 		 356 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  37.86 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  34.28 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  37.94 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  37.05 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  34.49 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  35.58 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  35.52 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  34.62 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  34.37 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  32.39 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  33.13 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  34.37 
 
 		 355 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  34.06 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  34.06 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  34.06 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  34.06 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  34.06 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  33.76 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  31.9 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  32.62 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  31.9 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  33.12 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  31.27 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  32.92 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  35.5 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  36.14 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  33.43 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  32.38 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  34.16 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 368 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  29.87 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  29.69 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  37.36 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  33.53 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  34.4 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  30.84 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2947  basic membrane lipoprotein  32.7 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  33 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  32.08 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  33.76 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  34.5 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  34.64 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  31.16 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  32.58 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  32.76 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  32.99 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  32.08 
 
 		 334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  34 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  28.27 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  37.41 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  36.68 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  33.67 
 
 		 351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.39 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  30.54 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  34.38 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  33.1 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0755  basic membrane lipoprotein  32.65 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  30.75 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  30.26 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  27.3 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  32.54 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  32.39 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  37.26 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.95 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  30.12 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  30.72 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  33.1 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  25 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  32.51 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  30.67 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  32.62 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  31.63 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  31.08 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  30.9 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  35 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  30.56 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>