255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1340 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
368 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  71.05 
 
 
341 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  73.07 
 
 
354 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  71.83 
 
 
347 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  62.39 
 
 
338 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  62.28 
 
 
329 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  58.91 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  45 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  48.53 
 
 
337 aa  269  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  37.84 
 
 
340 aa  227  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  39.8 
 
 
330 aa  212  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  38.04 
 
 
335 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  38.2 
 
 
347 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  39.07 
 
 
339 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  38.64 
 
 
331 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  37.97 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  37.58 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  35.17 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  37.42 
 
 
332 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  37.83 
 
 
330 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  40.89 
 
 
350 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  37.5 
 
 
358 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  37.99 
 
 
330 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  40.45 
 
 
354 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  36.45 
 
 
346 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  37.82 
 
 
329 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  35.9 
 
 
370 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  35.54 
 
 
330 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  38.69 
 
 
331 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.13 
 
 
331 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  37.69 
 
 
355 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  38.13 
 
 
331 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  37.69 
 
 
355 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  37.69 
 
 
355 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  37.69 
 
 
355 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  37.69 
 
 
355 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  37.39 
 
 
358 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  42.02 
 
 
328 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  37.94 
 
 
355 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  34.27 
 
 
354 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  37.69 
 
 
355 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  37.62 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  36.49 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  34.43 
 
 
377 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  35.75 
 
 
363 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  37.39 
 
 
361 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  37.68 
 
 
357 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  34.07 
 
 
389 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  38.08 
 
 
346 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
329 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  33.04 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  34.64 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  31.91 
 
 
357 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  37.74 
 
 
334 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  33.98 
 
 
334 aa  172  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  35.74 
 
 
358 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  37.72 
 
 
366 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  34.64 
 
 
376 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  37.46 
 
 
348 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  33.55 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  35.53 
 
 
380 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  32.57 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  34.39 
 
 
713 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  36.77 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  35.84 
 
 
368 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  36.57 
 
 
358 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  34.7 
 
 
382 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  35.29 
 
 
327 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  34.97 
 
 
340 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 
366 aa  156  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  37.07 
 
 
359 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  37.07 
 
 
359 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  35.15 
 
 
365 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  35.08 
 
 
356 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  35.78 
 
 
386 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  31.73 
 
 
322 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
366 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  35.06 
 
 
364 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  34.08 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  32.25 
 
 
356 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  36.92 
 
 
413 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  35.56 
 
 
407 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  31.86 
 
 
356 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  33.04 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  35.2 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  29.75 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  31.51 
 
 
353 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  34.63 
 
 
403 aa  139  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.76 
 
 
349 aa  138  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  29.77 
 
 
331 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  34.1 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  31.23 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  31.03 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  34.62 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  32.84 
 
 
357 aa  133  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  34.25 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  33.1 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1451  basic membrane lipoprotein  34.01 
 
 
337 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>